18例配对PDO与腹水样本的sWGS数据集及3例PDO的scDNA测序

资源简介

18例配对PDO与腹水样本的sWGS数据集及3例PDO的scDNA测序

该数据集收录于omicsdi.org，分类归属于肿瘤领域下的腹膜癌病方向，主题标签为基因组学（Genomics）。其核心内容围绕腹膜癌病相关样本的基因组测序展开，包含18例配对的PDO（患者来源类器官）与腹水样本的浅全基因组测序（sWGS）数据，并在此基础上对其中3例PDO样本进一步开展了单细胞DNA测序（scDNA）。整体而言，该数据集为研究腹膜癌病中类器官与腹水样本之间的基因组特征提供了测序层面的原始数据支撑，适用于肿瘤基因组学、腹膜癌病机制探索及相关方法学开发等方向。

【数据集背景】

腹膜癌病是肿瘤领域中的一类重要病变状态，其研究常需要借助患者来源的模型与临床样本进行比对分析。PDO（患者来源类器官）作为一种体外模型，能够在一定程度上保留原肿瘤的组织学与基因组学特征；腹水样本则直接来源于患者体内，反映肿瘤在腹腔内的播散情况。将PDO与配对腹水样本同时纳入测序分析，有助于在基因组层面观察两者之间的一致性与差异。该数据集正是在这一研究背景下产生，聚焦于腹膜癌病相关的配对样本，采用浅全基因组测序与单细胞DNA测序两种技术路线，为相关研究提供数据基础。

【数据内容】

该数据集包含两类测序数据。第一类为浅全基因组测序（sWGS）数据，覆盖18例配对的PDO与腹水样本，即每一例均包含对应的PDO样本与腹水样本，形成配对设计。第二类为单细胞DNA测序（scDNA）数据，针对上述PDO中的3例开展。数据主题标签为基因组学，表明其内容属于基因组层面的测序信息。除上述样本数量与测序类型外，源站未提供关于数据文件格式、数据量大小、测序深度、覆盖度、变异检出结果等更细粒度的描述。

【采集与来源】

该数据集来源于omicsdi.org。根据源站描述，其样本构成包括18例配对的PDO与腹水样本，以及其中3例PDO的单细胞DNA测序。关于样本的具体采集地点、采集时间、患者临床信息、伦理审批信息、样本处理流程及测序平台等细节，源站未提供。

【适用场景】

基于其数据构成，该数据集可适用于腹膜癌病相关的基因组学研究场景，例如比较PDO与配对腹水样本在浅全基因组测序层面的基因组特征，或利用3例PDO的单细胞DNA测序数据探讨PDO内部的细胞基因组异质性。同时，该数据集也可作为肿瘤类器官与临床样本配对研究的参考数据，用于方法学验证、分析流程测试或与其他腹膜癌病相关数据集进行整合分析的探索。需要说明的是，具体适用场景需结合源站未提供的实验设计与临床背景信息进一步判断。

【使用方法】

该数据集可通过omicsdi.org获取。关于数据的具体下载方式、访问链接、文件组织格式、是否需注册或申请权限、配套的分析工具与流程等信息，源站未提供。使用者在获取数据后，应根据自身研究目的选择相应的分析策略，例如针对sWGS数据进行拷贝数变异分析，或针对scDNA数据进行单细胞水平的基因组分析。由于源站未提供详细的使用说明，建议使用者结合数据实际格式与自身分析需求进行处理。

【质量与限制】

该数据集包含18例配对样本的sWGS数据与3例PDO的scDNA数据，样本量相对有限，尤其是单细胞DNA测序仅覆盖3例PDO。关于数据质量指标，如测序深度、覆盖均匀性、比对率、细胞过滤标准、质控结果等，源站未提供。此外，样本的临床背景、随访信息、病理分型等也可能影响数据的适用范围，但源站未提供相关内容。因此，在使用该数据集时，应充分考虑样本量与信息完整性的限制，避免过度外推结论。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、原始文献、DOI、许可协议、使用条款及数据共享政策等信息，源站未提供。使用者在引用或使用该数据集前，应自行查阅omicsdi.org上的相关说明，或联系数据提供方以确认具体的引用要求与许可条件。