前庭神经鞘瘤DNA甲基化数据集

包含36例前庭神经鞘瘤、4例非前庭神经鞘瘤和5例健康神经样本的DNA甲基化芯片数据。由NIH Gene Expression Omnibus提供,来自GEO,数据格式为表格,包含45条数据记录,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的周围神经肿瘤研究。

NIH Gene Expression OmnibusNIH Gene Expression Omnibus
GEO
2019-01-25 更新
浏览 32
表格分类Expression profiling by arrayGPL107399606
GSE56597

基本信息

模态
表格
大小
0.266341069 GB
数据量
45
任务类型
分类
创建/更新时间
2019-01-25

资源简介

前庭神经鞘瘤DNA甲基化数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Wide methylation analysis in vestibular schwannoma [Affymetrix exon level analysis]》。源站首次发布:Apr 08 201。

【数据内容】

源站原始描述:Vestibular schwannomas are intracranial tumors that affects unilateral and sporadically or bilateral when is associated to Neurofibromatosis type 2 syndrome. The hallmark of the disease is the biallelic inactivation by NF2 gene mutation or LOH of chromosome 22q, where this gene harbors. In this work, we used Infinium HumanMethylation 450K BeadChip microarrays in a series of 36 vestibular schwannomas, 4 non-vestibular schwannomas and 5 healthy nerves. Our results shows a trend to hypomethylation…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL10739、9606。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE56597

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jan 25 201,引用时请注意版本时效。

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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE56597

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

包含36例前庭神经鞘瘤、4例非前庭神经鞘瘤和5例健康神经样本的DNA甲基化芯片数据。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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