ST005077:非靶向代谢组学揭示DHODH和SLC29A1联合抑制破坏胰腺癌细胞嘧啶代谢并耗竭核苷池

该研究以人(Homo sapiens)为物种对象,采用液相色谱-质谱(LC-MS)技术,围绕 DHODH 与 SLC29A1 联合抑制后胰腺癌细胞的嘧啶代谢紊乱与核苷池耗竭这一问题展开

Ohio State UniversityOhio State University
metabolomics_workbench
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文本分类LC-MS
ST005077: Untargeted Metabolomics Reveals That Combined DHODH and SLC29A1 Inhibition Disrupts Pyrimidine Metabolism and Depletes Nucleoside Pools in Pancreatic Cancer Cells

基本信息

模态
文本
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

ST005077:非靶向代谢组学揭示DHODH和SLC29A1联合抑制破坏胰腺癌细胞嘧啶代谢并耗竭核苷池

ST005077 是收录于代谢组学工作台(metabolomicsworkbench.org)的一项非靶向代谢组学研究数据集,其英文标题为“Untargeted Metabolomics Reveals That Combined DHODH and SLC29A1 Inhibition Disrupts Pyrimidine Metabolism and Depletes Nucleoside Pools in Pancreatic Cancer Cells”。该研究以人(Homo sapiens)为物种对象,采用液相色谱-质谱(LC-MS)技术,围绕 DHODH 与 SLC29A1 联合抑制后胰腺癌细胞的嘧啶代谢紊乱与核苷池耗竭这一问题展开。

【数据集背景】

从标题所体现的研究取向看,该工作属于肿瘤代谢研究方向,所关注的生物学问题集中在胰腺癌细胞的嘧啶代谢通路以及核苷酸、核苷池的维持状态。DHODH 与 SLC29A1 在标题中被并列为两个干预靶点,说明研究设计以二者的联合抑制为核心处理条件,并以此观察代谢层面的响应。该数据集在站点分类中归入“肿瘤 / 其他”。

就代谢组学的通行背景而言,非靶向分析通常是在不预设目标物名单的前提下,尽可能广泛地检测样本中的小分子代谢物,以便发现处理后发生扰动的代谢环节;嘌呤与嘧啶核苷酸合成、补救途径的变化,是肿瘤代谢研究中经常被讨论的内容。这些只是该研究方向的通用说明,并不构成对该数据集实验设计的具体描述。关于研究所用的细胞系、药物浓度、处理时长、对照组设置等信息,源站未提供。

【数据内容】

可以确认的是,该数据集属于非靶向代谢组学类型,检测手段为 LC-MS,研究对象为人来源样本。至于数据中究竟包含多少个样本、检出并注释了多少种代谢物、是否包含定量矩阵、是否提供通路富集或统计分析结果,源站未提供。因此无法就数据表的行列结构、代谢物命名体系、丰度单位等作出说明,源站未提供相应内容。

【采集与来源】

该数据集的来源站点为 metabolomicsworkbench.org,来源研究机构为 Ohio State University(俄亥俄州立大学),物种标注为 Homo sapiens,分析技术为 LC-MS。该条目在站点中以 LC-MS 作为主题标识。除上述信息外,采样时间、样本类型与制备流程、色谱柱与流动相条件、质谱仪型号与采集参数、数据处理软件及版本等细节,源站均未提供。

【适用场景】

基于已有信息,该数据集适用于对胰腺癌细胞嘧啶代谢、核苷池调控以及 DHODH、SLC29A1 相关抑制策略感兴趣的代谢组学与肿瘤代谢研究场景,也可作为非靶向 LC-MS 代谢组学数据的一个检索目标,用于了解该研究方向下的公开数据资源分布。需要说明的是,能否将其用于具体的再分析、跨数据集整合或方法学比较,取决于使用者对样本设计、数据格式与质量水平的判断,而这些信息源站未提供,因此无法在此给出确定结论。

【使用方法】

源站未提供数据的下载格式、文件组织方式、访问权限与配套使用说明。检索时可通过数据集编号 ST005077 在 metabolomicsworkbench.org 上定位该条目,但该条目具体以何种形式提供数据、是否需要注册或申请,源站未提供。若需了解代谢物注释表、原始图谱或处理后矩阵的获取途径,应以源站页面的实际说明为准,此处不作推测。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质控指标、重复样本数量、缺失值比例、代谢物鉴定置信度以及批次效应处理情况。就方法学的一般认识而言,非靶向代谢组学的结果常受到样本前处理、仪器稳定性与代谢物注释可靠性等因素影响,但该数据集在这些方面的具体表现,源站未提供,无法评价。使用者在解读或再利用时应自行核实,源站未提供可据以判断质量水平的细节。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式、作者列表、发表文献信息以及使用许可条款。若需在论文或报告中引用,应查阅源站条目页面以获取正式说明,此处不代为拟写引用条目,也不对许可条件作出任何推断。

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源站:https://metabolomicsworkbench.org/data/DRCCMetadata.php?Mode=Study&StudyID=ST005077

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

代谢组学研究(LC-MS)。物种:Homo sapiens。机构:Ohio State University。

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