胰腺肿瘤刮取增强类器官发育和精准医学方法
胰腺癌患者来源类器官建立方法比较数据集，通过肿瘤刮取与标准切片样本优化类器官开发，促进精准医学。
基本信息
模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-08
资源简介
该数据集来自NIAID数据生态系统，聚焦胰腺导管腺癌（PDAC），通过比较肿瘤切面刮取样本与标准组织切片样本在患者来源类器官（PDO）建立中的可行性，旨在利用侵袭前沿的活性肿瘤细胞。数据包含26例患者的肿瘤刮取物及其匹配组织切片，可能涉及基因组测序数据（SRA链接）及临床信息，用于评估类器官建立效率和药物反应预测，支持精准医学研究。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRP665274
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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