GSE311738:E96A TMZ 处理研究
该数据集来自 NCBI GEO,聚焦胰腺导管腺癌(PDAC)细胞在替莫唑胺(TMZ)处理下的转录响应。研究对 Pa03C Cas9 与 E96A 突变细胞系进行 TMZ 处理 4 小时或 8 小时,并设未处理对照,通过 RNA-seq 获取表达谱

基本信息
资源简介
GSE311738:E96A TMZ 处理研究
E96A TMZ Treatment Study
该数据集来自 NCBI GEO,聚焦胰腺导管腺癌(PDAC)细胞在替莫唑胺(TMZ)处理下的转录响应。研究对 Pa03C Cas9 与 E96A 突变细胞系进行 TMZ 处理 4 小时或 8 小时,并设未处理对照,通过 RNA-seq 获取表达谱。数据可用于分析 APE1 内切酶活性受损背景下,基因型特异且随时间变化的烷基化应激转录反应,适合差异表达、通路富集及时间序列建模等分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Nov 28 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):替莫唑胺(TMZ)诱导的 DNA 烷基化损伤主要通过碱基切除修复进行修复。为表征在 APE1 内切酶活性受损背景下的转录响应,对经处理的 Pa03C Cas9 和 E96A 突变细胞系进行了 RNA-seq。细胞用 TMZ 处理 4 小时或 8 小时,并设未处理对照。该数据集捕获了 PDAC 细胞中对烷基化应激的基因型特异性和时间依赖性转录响应。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/胰腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE311738
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 21 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
替莫唑胺(TMZ)诱导的DNA烷基化损伤主要通过碱基切除修复途径进行修复。为在APE1核酸内切酶活性受损的背景下表征对TMZ的转录反应,我们对经处理的Pa03C Cas9和E96A突变细胞系进行了RNA-seq。细胞分别接受TMZ处理4小时或8小时,并设未处理对照。该数据集捕获了PDAC细胞中对烷基化应激的基因型特异性和时间依赖性转录反应。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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