人类胰腺癌基因分型
人类胰腺癌基因分型数据集，包含胰腺癌样本的基因组数据，用于研究遗传变异。
基本信息
资源简介
人类胰腺癌基因分型
【一句话概览】
本数据集是 BioStudies 公开的组学数据集，主题涵盖 genotyping by array、Homo sapiens，可用于生物标志物发现与分子分型研究。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Genotyping of human pancreatic cancer》。
【数据内容】
源站原始描述：To identify genomic abnormalities characteristic of pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) in vivo, a panel of 27 microdissected PDAC specimens were analyzed using high-density microarrays representing ~116 000 single nucleotide polymorphism (SNP) loci. We detected frequent gains of 1q, 2, 3, 5, 7p, 8q, 11, 14q and 17q (>78% of cases), and losses of 1p, 3p, 6, 9p, 13q, 14q, 17p and 18q (>44%). Although the results were comparable with those from array CGH, regions of those genetic changes were…
【主题与分类】
主题标签：genotyping by array、Homo sapiens。
【适用方向】
组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ebi.ac.uk/biostudies/ArrayExpress/studies/E-GEOD-7130
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ebi.ac.uk/biostudies/ArrayExpress/studies/E-GEOD-7130
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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