患者来源胰腺癌异种移植基因表达谱预测BET溴结构域抑制剂JQ1敏感性
55例胰腺癌PDX基因表达谱用于预测JQ1药物敏感性，涉及MYC亚组分类及标志物验证。
基本信息
资源简介
患者来源胰腺癌异种移植基因表达谱预测BET溴结构域抑制剂JQ1敏感性
【一句话概览】
本数据集是 NCBI 公开的组学数据集，收录 1 个文件，主题涵盖 Expression profiling by array、GPL16686、9606，可用于生物标志物发现与分子分型研究。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Gene Expression Profiling of Patient-Derived Pancreatic Cancer Xenografts predicts sensitivity to the BET bromodomain inhibitor JQ1: Implications to individualized medicine efforts》。源站首次发布：Nov 13 201。
【数据内容】
源站原始描述：c-Myc controls more than 15% of genes responsible for proliferation, differentiation, and cellular metabolism in pancreatic as well as other cancers making this transcription factor a prime target for treating patients. The transcriptome of 55 patient derived xenografts show that 30% of them share an exacerbated expression profile of MYC transcriptional targets (MYC-high). This cohort is characterized by a high level of Ki67 staining, a lower differentiation state and a shorter survival time com…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL16686、9606。
【适用方向】
组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE89792
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 22 201，引用时请注意版本时效。
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源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE89792
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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