ApoE缺失调控金黄色葡萄球菌骨髓炎RNA-seq数据集
ApoE骨髓炎模型RNA-seq数据
基本信息
资源简介
ApoE缺失调控金黄色葡萄球菌骨髓炎RNA-seq数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Apolipoprotein E deficiency potentiates macrophage resistance to staphylococcus aureus osteomyelitis via regulating cholesterol metabolism》。源站首次发布：Mar 16 202。
【数据内容】
源站原始描述：To explore how APOE functions in the mechanism of regulation of cholesterol metabolism during S. aureus osteomyelitis, we established S. aureus osteomyelitis models in WT mice and APOE knockout mice
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by high throughput sequencing、GPL21103、10090。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE227521
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 14 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE227521
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
小鼠金黄色葡萄球菌骨髓炎模型RNA-seq数据，比较野生型和ApoE敲除小鼠骨髓表达差异。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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