骨髓炎中骨母细胞金黄色葡萄球菌感染RNA-seq数据集
骨母细胞感染RNA-seq数据
基本信息
资源简介
骨髓炎中骨母细胞金黄色葡萄球菌感染RNA-seq数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Staphylococcus aureus infection induces the production of the neutrophil chemoattractants CXCL1, CXCL2, CXCL3, CXCL5, CCL3, and CCL7 by osteoblasts》。源站首次发布：Nov 07 202。
【数据内容】
源站原始描述：Staphylococcus aureus is the principal causative agent of osteomyelitis, a serious bacterial infection of bone that is associated with progressive inflammatory damage. Bone-forming osteoblasts have increasingly been recognized to play an important role in the initiation and progression of detrimental inflammation at sites of infection, and have been demonstrated to release an array of inflammatory mediators and factors that promote osteoclastogenesis and leukocyte recruitment following bacterial…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by high throughput sequencing、GPL21493、10090。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE217455
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 14 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE217455
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含未感染与金黄色葡萄球菌感染小鼠骨母细胞RNA-seq数据，用于研究骨髓炎炎症趋化因子表达。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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