小鼠神经纤维瘤形成单细胞RNA测序数据集
小鼠NF1神经纤维瘤单细胞数据
基本信息
资源简介
小鼠神经纤维瘤形成单细胞RNA测序数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Cxcr3 expressing leukocytes are necessary for neurofibroma formation in mice》。源站首次发布：Nov 20 201。
【数据内容】
源站原始描述：Plexiform neurofibroma is a major contributor to morbidity in Neurofibromatosis type I (NF1) patients. Macrophages and mast cells infiltrate neurofibroma, and data from mouse models implicate these leukocytes in neurofibroma development. Anti-inflammatory therapy targeting these cell populations has been suggested as a means to prevent neurofibroma development. Here, we compare gene expression in inflamed nerves from NF1 models which invariably form neurofibroma to those with inflammation driven…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by high throughput sequencing、GPL17021、10090。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE122730
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 21 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE122730
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 0.10 GB。
数据说明
小鼠NF1模型神经/DRG单细胞RNA测序数据，用于研究Cxcr3相关免疫细胞在神经纤维瘤形成中的作用。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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