整合体细胞与胚系计算生物学以重新定义实体瘤临床可操作性
胃肠胰神经内分泌肿瘤(GEP-NETs)单细胞RNA测序数据集,涵盖胰腺、小肠和胃周NET,用于肿瘤免疫微环境和精准医学研究。

基本信息
资源简介
该数据集源自NIAID Data Ecosystem/dbGaP研究phs003141,包含胃肠胰神经内分泌肿瘤(GEP-NETs)新鲜切除样本的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,覆盖4例胰腺NET、3例小肠NET和1例胃周NET。研究分析肿瘤与免疫细胞图谱,比较恶性GEP-NET与正常胃肠内分泌细胞分化及命运决定阶段的基因和调控子表达,并刻画免疫-免疫及免疫-肿瘤相互作用网络,以揭示GEP-NET解剖亚型的转录组异质性和精准医学治疗机会。纳入标准为病理诊断为NET;排除分析样本不足者。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs003141.v1.p1
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




