整合体细胞与胚系计算生物学以重新定义实体瘤临床可操作性

胃肠胰神经内分泌肿瘤(GEP-NETs)单细胞RNA测序数据集,涵盖胰腺、小肠和胃周NET,用于肿瘤免疫微环境和精准医学研究。

NIAID Data Ecosystem
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单细胞转录组胃肠胰神经内分泌肿瘤单细胞转录组
Integrative Somatic and Germline Computational Biology to Redefine Clinical Actionability in Solid Tumors

基本信息

模态
单细胞转录组
创建/更新时间
2026-10-08
版本
v1.p1

资源简介

该数据集源自NIAID Data Ecosystem/dbGaP研究phs003141,包含胃肠胰神经内分泌肿瘤(GEP-NETs)新鲜切除样本的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,覆盖4例胰腺NET、3例小肠NET和1例胃周NET。研究分析肿瘤与免疫细胞图谱,比较恶性GEP-NET与正常胃肠内分泌细胞分化及命运决定阶段的基因和调控子表达,并刻画免疫-免疫及免疫-肿瘤相互作用网络,以揭示GEP-NET解剖亚型的转录组异质性和精准医学治疗机会。纳入标准为病理诊断为NET;排除分析样本不足者。

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