12例尿路上皮癌组织切片Xenium数据（2/2）

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.18328035

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含由两张Xenium载玻片生成的空间转录组学数据，其中包括来自12名尿路上皮癌患者的组织微阵列（TMA）芯。数据采用Human Immuno-Oncology panel，按照制造商协议（CG000582 Rev E, 10x Genomics）获取。由于文件较大，数据集以压缩档案形式提供，并分割成多个部分。注意： 在重建之前，所有.partXXX文件必须位于同一目录中。数据集信息 技术：10x Genomics Xenium In situ 样本：尿路上皮癌（组织微阵列芯） 组织类型：福尔马林固定石蜡包埋组织 患者数量：12 物种：Homo sapiens 基因面板：Human Immuno-Oncology Panel

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。