Karyoptosis 与神经退行性疾病研究及药物重定位数据集 - PathMap 实验 #000036

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.21284225

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 1.1 MB。

数据说明

交互式数据查看器：从第1天起即可阅读、查看和打印
使用我们的全交互式查看器，从第1天起即可查看、阅读和打印本研究数据：https://pathmap.org/viewer.php?id=36

Artificial General Intelligence LLC
所评估的声明：什么是Karyoptosis，以及它如何与过去和当前的神经退行性疾病研究相契合？Karyoptosis是否提供了一种新的情境，使一类新的重定位治疗药物得以形成？该数据集包含原始JSON执行轨迹、经核验的逐字引文，以及由PathMap Studio的Veridical Enforcement引擎生成的与MeSH对齐的逻辑门。

🔍 新颖且被忽视的洞见
Karyoptosis不同于细胞凋亡、自噬和坏死性凋亡，具有自身独特的生化特征。
p38激酶信号通路调节核纤层稳定性，特别是调控LaminB1，这凸显出一个可用于预防Karyoptosis的可成药激酶靶点。
Karyoptosis中核破裂的“爆炸性”特征与经典细胞凋亡中受控的碎裂形成对比。
有证据表明，抑制自噬可直接触发这种特定形式的调节性细胞死亡。

核仁应激以及核仁素等蛋白的错误定位，正成为神经退行性变中导致核死亡（karyoptosis）的核不稳定性的新兴指标。caspase 依赖性死亡与以 AIF 介导的核改变为特征的 caspase 非依赖性通路之间存在明确区别。癌症生物学中 CREB3 裂解的研究为开发以神经保护为目标的疗法提供了模板。核膜完整性是健康功能和病理性退变共有的机械敏感枢纽。兼具凋亡和坏死特征的“混合型”细胞死亡表型的存在，要求对神经元丢失建立更精细的分类系统。核死亡与凋亡、自噬、坏死性凋亡和焦亡存在根本区别，因此需要重新分类。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。