EGFR突变肺腺癌中的独特microRNA表达谱

该数据集来自omicsdi.org,聚焦EGFR突变肺腺癌中的microRNA表达特征。研究检测了154例肺腺癌肿瘤组织与20例配对正常肺组织的microRNA表达,共分析174个样本,并将表达数据与临床变量、EGFR及KRAS突变状态和进展时间相关联

omicsdi
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基因组分类Transcriptomics
Unique microRNA profiles in EGFR-mutated lung adenocarcinomas

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-05

资源简介

EGFR突变肺腺癌中的独特microRNA表达谱

该数据集名为“Unique microRNA profiles in EGFR-mutated lung adenocarcinomas”,来源于omicsdi.org,归类于肿瘤/其他方向,主题标签为Transcriptomics。数据集聚焦于EGFR突变肺腺癌中的microRNA表达特征,研究检测了154例肺腺癌肿瘤组织与20例配对正常肺组织的microRNA表达,共分析174个样本,并将microRNA表达数据与临床变量、EGFR及KRAS突变状态和进展时间进行关联分析。该数据集未包含重复样本或对照样本,旨在揭示EGFR突变肺腺癌中独特的microRNA表达谱,为理解该亚型肺癌的分子机制提供转录组层面的数据支持。

【数据集背景】

肺癌是全球范围内发病率和死亡率较高的恶性肿瘤之一,其中肺腺癌是常见的组织学亚型。EGFR突变在肺腺癌患者中占有一定比例,针对EGFR突变的靶向治疗已成为重要的临床策略。然而,microRNA作为基因表达调控的重要分子,在EGFR突变肺腺癌中的表达特征及其与临床变量、KRAS突变状态和疾病进展的关系尚需深入探索。该数据集正是基于这一背景,对154例肺腺癌肿瘤组织及20例配对正常肺组织的microRNA表达进行检测,试图刻画EGFR突变肺腺癌中独特的microRNA表达谱,并将表达信息与临床变量、EGFR和KRAS突变状态以及进展时间相联系,从而为后续生物标志物发现和机制研究提供基础数据。

【数据内容】

该数据集包含174个样本的microRNA表达分析结果,其中154个样本来自肺腺癌肿瘤组织,20个样本来自配对的正常肺组织。研究检测了这些样本中的microRNA表达水平,并将表达数据与临床变量、EGFR突变状态、KRAS突变状态以及进展时间进行关联。数据集的主题标签为Transcriptomics,表明其属于转录组学范畴,关注的是microRNA层面的表达信息。源站描述中未提供具体的microRNA种类数量、表达定量方法或临床变量的详细列表,因此这些细节在源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于omicsdi.org,该平台汇总了多组学数据资源。根据源站描述,研究共分析了174个样本,包括154例肺腺癌肿瘤组织和20例配对正常肺组织样本。样本采集的具体时间、地点、机构以及患者人群特征等信息,源站未提供。数据生成的技术平台、测序或芯片型号、数据处理流程等细节,源站未提供。配对正常肺组织来自同一患者的癌旁正常组织,这一配对设计有助于减少个体间差异对表达谱比较的影响。数据集未包含重复样本或对照样本,这一特点在源站描述中有明确说明。

【适用场景】

该数据集适用于探索EGFR突变肺腺癌中microRNA表达特征的研究。具体而言,可用于分析肿瘤组织与配对正常肺组织之间microRNA表达的差异,识别在EGFR突变背景下独特表达的microRNA。此外,由于表达数据与临床变量、EGFR及KRAS突变状态和进展时间相关联,该数据集也可用于研究microRNA表达与这些临床和分子特征之间的关系,例如寻找与EGFR或KRAS突变状态相关的microRNA,或探索与疾病进展时间相关的microRNA标志物。该数据集还可作为转录组学研究的参考数据,用于比较不同肺腺癌亚型或不同突变状态下的microRNA表达模式。由于未包含重复样本或对照样本,该数据集更适合作为发现性研究的起点,而非直接用于验证性分析。

【使用方法】

该数据集可通过omicsdi.org获取,具体的数据下载方式、文件格式和访问权限需参考源站提供的说明。使用时可依据样本类型(肿瘤组织与配对正常肺组织)进行分组比较,分析microRNA表达差异。由于数据与临床变量、EGFR和KRAS突变状态及进展时间关联,使用者可将表达数据与这些变量结合,进行相关性分析或生存分析。分析时需注意样本配对关系,即20例正常肺组织与部分肿瘤组织来自同一患者,应采用配对统计方法以控制个体差异。对于未提供重复样本或对照样本的特点,使用者在设计分析时应避免依赖重复测量或对照比较的统计方法。具体的数据处理流程、归一化方法和分析工具,源站未提供,使用者需根据数据格式自行选择合适的方法。

【质量与限制】

该数据集的一个显著限制是未包含重复样本或对照样本,这可能影响统计功效和结果的可重复性评估。样本量方面,154例肿瘤组织和20例配对正常肺组织共174个样本,对于microRNA表达谱研究而言属于中等规模,但正常组织样本量相对较少。源站描述中未提供数据质量控制指标、缺失值情况、批次效应信息或技术验证结果,因此无法评估数据质量的详细水平。此外,临床变量、EGFR和KRAS突变状态及进展时间的具体定义和测量方法,源站未提供,这可能影响这些变量在分析中的可用性和一致性。数据集仅涵盖microRNA表达层面,未包含其他组学数据,因此无法直接进行多组学整合分析。使用者应结合自身研究目的,谨慎解释基于该数据集得出的结论。

【引用与许可】

该数据集的引用方式、许可协议和使用条款,源站未提供。使用者应访问omicsdi.org上该数据集的页面,查看是否有相关的引用要求、数据使用协议或版权声明。在未明确许可的情况下,应遵循源站的一般使用政策,并尊重数据提供者的权益。源站未提供具体的引用文献或致谢要求,因此在使用该数据集发表研究成果时,建议直接参考源站页面上的最新说明。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-48414

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们检测了154份肺腺癌样本和20份配对正常肺组织样本中的microRNA表达,并研究了microRNA表达与临床变量、EGFR和KRAS突变状态及进展时间的关系。共分析了174份样本,其中154份来自肺腺癌肿瘤组织,20份来自配对正常肺组织样本。未包含重复样本或对照样本。

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