TTUHSC PDX COG-N-649x 肾上腺神经母细胞瘤

主题标签:神经母细胞瘤、PDX模型、肾上腺、TTUHSC、肿瘤、NSG小鼠、骨髓。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖神经母细胞瘤。

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基因组分类神经母细胞瘤PDX模型肾上腺TTUHSC肿瘤NSG小鼠骨髓
[TTUHSC] [PDX] [COG-N-649x] Adrenal Gland Neuroblastoma

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-05

资源简介

TTUHSC PDX COG-N-649x 肾上腺神经母细胞瘤

主题标签:神经母细胞瘤、PDX模型、肾上腺、TTUHSC、肿瘤、NSG小鼠、骨髓。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖神经母细胞瘤。

【数据集背景】

该数据集对应的英文名称为 [TTUHSC] [PDX] [COG-N-649x] Adrenal Gland Neuroblastoma,来源于 ebi.ac.uk,在分类上归属于肿瘤 / 其他。从名称与来源信息可以看出,这是一个围绕肾上腺神经母细胞瘤建立的 PDX 模型相关数据集。神经母细胞瘤是起源于神经嵴细胞的肿瘤,常见于肾上腺等部位,而 PDX 模型即人源肿瘤异种移植模型,通常用于在免疫缺陷小鼠体内保留患者肿瘤的组织学与分子特征。该数据集的主题标签包括神经母细胞瘤、PDX 模型、肾上腺、TTUHSC、肿瘤、NSG 小鼠、骨髓,说明其内容与肾上腺神经母细胞瘤的 PDX 建模密切相关。整体而言,该数据集为肿瘤研究领域提供了一个公开可获取的资源,重点覆盖神经母细胞瘤的 PDX 模型信息。

【数据内容】

该数据集的核心对象是编号为 COG-N-649x 的肾上腺神经母细胞瘤 PDX 模型。源站描述中提及该模型来自女性,年龄范围为 2 - 9,具体年龄未提供。肿瘤类型标注为原发性神经系统癌症,涉及部位包括肾上腺,nos 以及骨髓。模型所使用的宿主小鼠为 NSG 品系,具体为 NOD.Cg-Prkdc scid Il2rg tm1Wjl /SzJ。样本类型为组织碎片,状态为新鲜。源站描述还特别指出,该 PDX 模型已经过多次传代测试并得到确认。除上述内容外,数据集是否包含分子分型、基因表达、突变谱、药物响应等更细粒度的数据字段,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ebi.ac.uk。源站描述中出现了 Texas Tech University Health Sciences Center (TTUHSC),表明该 PDX 模型与德克萨斯理工大学健康科学中心有关。模型编号 COG-N-649x 中的 COG 可能指向儿童肿瘤学组相关命名体系,但源站未对此作出进一步说明。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息、患者临床背景、治疗史以及样本处理流程的详细步骤,源站未提供。宿主小鼠为 NSG 品系,样本以新鲜组织碎片形式进行移植,这些信息构成了该模型建立与保存方式的基本描述。至于传代次数、传代间隔、模型稳定性验证的具体实验细节,源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于与肾上腺神经母细胞瘤相关的肿瘤学研究,尤其是围绕 PDX 模型开展的应用场景。由于该模型为人源肿瘤异种移植模型,并已在 NSG 小鼠中经过多次传代确认,理论上可用于研究肿瘤在体内的生长特性、组织形态保留情况以及潜在的治疗响应探索。主题标签中同时包含骨髓,提示该模型可能涉及骨髓相关研究或转移研究,但源站未明确说明其具体用途。该数据集属于肿瘤领域的公开数据集,可用于神经母细胞瘤的基础与转化研究。关于是否适合药物筛选、靶点验证、生物标志物发现或免疫治疗研究,源站未提供明确说明,因此不能据此推断其具体适用范围。

【使用方法】

该数据集通过 ebi.ac.uk 公开获取。源站描述中包含了知识共享 CC0 1.0 通用公共领域贡献许可的链接信息,表明其许可方式为 CC0 1.0。关于数据的具体下载方式、文件格式、数据组织架构、是否附带元数据表格、是否提供原始测序数据或病理图像、是否需要注册或申请访问权限,源站未提供。使用者在获取该 PDX 模型相关信息时,应依据源站的实际数据页面进行操作。若涉及动物实验或后续移植实验,需遵循相应的伦理与生物安全规范,但源站未提供具体的操作指南或培养、移植、传代的标准流程。

【质量与限制】

源站描述明确指出,该 PDX 模型已经过多次传代测试并得到确认,这在一定程度上说明模型具有可重复性和稳定性。然而,关于模型的质量控制指标,如组织学一致性、分子特征保留程度、肿瘤生长曲线、传代稳定性定量数据等,源站未提供。该数据集在年龄字段上仅给出 2 - 9 的范围,未提供确切年龄;性别为女性;肿瘤类型标注为原发性神经系统癌症;部位包括肾上腺,nos 和骨髓。这些信息相对有限,可能影响对模型背景的完整理解。此外,宿主小鼠为 NSG 品系,属于免疫缺陷小鼠,其微环境与人体存在差异,这是 PDX 模型的通用局限,但源站未针对该模型给出具体的局限性说明。关于数据完整性、样本量、是否存在缺失字段或批次效应,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的许可方式为 CC0 1.0,即公共领域贡献许可。源站描述中包含了指向 creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/ 的链接信息。在引用该数据集时,应按照源站要求注明来源,包括数据集英文名称 [TTUHSC] [PDX] [COG-N-649x] Adrenal Gland Neuroblastoma 以及来源站 ebi.ac.uk。关于具体的引用格式、是否要求同时引用相关论文、通讯作者信息、版本号或发布日期,源站未提供。使用者应直接访问源站页面获取最新的引用与许可说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/S-CMO8340

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/ Texas Tech University Health Sciences Center (TTUHSC) female 2 - 9 Not Provided Primary Nervous System Cancer Not provided 4 adrenal gland, nos bone marrow nsg NOD.Cg-Prkdc scid Il2rg tm1Wjl /SzJ Tissue Fragment Fresh This PDX model has been tested and confirmed over multiple passages

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