脑转移瘤肿瘤可塑性与基质相互作用的转录组标志 [BrainMet_Othotopic]
数据聚焦脑转移瘤的转录组特征,涵盖肿瘤可塑性与基质相互作用相关标志,可用于探索脑转移过程中肿瘤细胞状态变化及其与微环境基质细胞互作的分子机制
![Transcriptomic hallmarks of tumor plasticity and stromal interactions in brain metastasis [BrainMet_Othotopic]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/116718_v20261104193351.jpg)
基本信息
资源简介
脑转移瘤肿瘤可塑性与基质相互作用的转录组标志 [BrainMet_Othotopic]
该数据集英文名为 Transcriptomic hallmarks of tumor plasticity and stromal interactions in brain metastasis [BrainMet_Othotopic],来源于 omicsdi.org,在本站归类于肿瘤 / 其他方向,主题标签为 Genomics。从名称与来源描述来看,该数据集围绕脑转移瘤的转录组特征展开,重点关注肿瘤可塑性以及基质相互作用相关的分子标志。脑转移是多种原发肿瘤进展过程中的严重并发症,肿瘤细胞进入脑组织后往往需要经历状态重塑,并与脑内微环境中的基质细胞发生复杂互作。该数据集以转录组层面的标志性特征为切入点,为研究脑转移过程中肿瘤细胞状态变化及其与微环境基质细胞互作的分子机制提供了数据基础,适合用于肿瘤生物学、神经肿瘤学以及肿瘤微环境相关研究方向的探索性分析。
【数据集背景】
脑转移瘤的发生发展并非肿瘤细胞单方面播散的结果,而是肿瘤细胞与脑内特殊微环境之间持续相互作用的过程。肿瘤细胞在脑组织中可能发生可塑性变化,表现为细胞状态的转换、分化特征的改变以及对微环境的适应;与此同时,基质细胞也参与构成支持肿瘤定植与生长的微环境。该数据集以转录组标志为核心,聚焦肿瘤可塑性与基质相互作用,旨在从基因表达层面刻画脑转移瘤的这些关键特征。其主题标签为 Genomics,说明数据主要服务于基因组学或转录组学层面的研究需求。本站将其归入肿瘤 / 其他分类,表明其属于肿瘤研究领域中的一个细分方向。
【数据内容】
该数据集的内容围绕脑转移瘤的转录组特征展开,涵盖与肿瘤可塑性及基质相互作用相关的标志。具体而言,其关注点包括脑转移过程中肿瘤细胞状态变化的分子表现,以及肿瘤细胞与微环境基质细胞互作的相关转录信号。数据集名称中的 BrainMet_Othotopic 提示其可能涉及原位脑转移模型或原位相关样本的转录组数据,但除名称本身外,源站未提供更详细的样本构成、基因数量、测序平台或数据文件类型等信息。主题标签 Genomics 表明数据可用于基因组学层面的分析,但具体的数据组织形式、表达矩阵结构或注释信息,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org,源站描述与其英文名称一致,均为 Transcriptomic hallmarks of tumor plasticity and stromal interactions in brain metastasis [BrainMet_Othotopic]。除来源站与名称外,源站未提供关于样本采集方式、实验设计、测序平台、物种来源、样本数量或采集时间等具体信息。因此,关于数据采集的详细流程与原始样本背景,源站未提供。
【适用场景】
基于其主题与描述,该数据集适用于脑转移瘤转录组特征相关的研究场景,例如探索肿瘤可塑性相关基因表达变化、分析肿瘤细胞与基质细胞互作的分子信号、筛选与脑转移微环境适应相关的候选标志物等。由于主题标签为 Genomics,其也可用于基因组学或转录组学层面的数据挖掘与比较分析。此外,该数据集可能对理解脑转移过程中肿瘤细胞状态转换及微环境调控机制具有参考价值。但具体适用场景仍需结合数据实际内容判断,源站未提供更详细的适用说明。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、文件格式、分析流程、推荐工具或代码示例等。使用者如需使用,应参考来源站 omicsdi.org 上的相关说明。由于源站未提供详细的使用指引,此处无法给出进一步的操作建议。
【质量与限制】
源站未提供该数据集的质量评估信息,包括数据完整性、测序深度、重复性、批次效应或质控指标等。其限制方面,源站亦未提供明确说明。需要注意的是,该数据集名称中标注为 BrainMet_Othotopic,可能提示其基于特定模型或样本类型,但这一命名的具体含义及适用范围,源站未提供进一步解释。因此,关于数据质量与限制的详细内容,源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或相关文献信息。使用者如需引用或使用该数据集,应访问来源站 omicsdi.org 查询相关说明。由于源站未提供引用与许可的具体内容,此处无法给出确切的引用格式或授权范围。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/project/PRJNA475786
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Transcriptomic hallmarks of tumor plasticity and stromal interactions in brain metastasis [BrainMet_Othotopic]
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




