伊立替康体内暴露后的人结肠癌干细胞群体（EpCAM+、CD44+、CD166+）转录谱分析

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE213103

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数据说明

在人类结肠癌中，肿瘤组织的恶性成分往往包含多种亚型的癌细胞，其转录谱和表面标志物表型与正常结肠隐窝中上皮细胞谱系（如杯状细胞、肠上皮细胞、LGR5+柱状基底细胞）相对应。在这些不同类型的恶性细胞中，那些具有位于结肠隐窝底部的上皮干/祖细胞特征性表面标志物表型（EpCAM+、CD44+、CD166+）的细胞，富含具有“癌症干细胞”（CSC）特性的细胞，如自我更新（即在免疫缺陷动物中连续异种移植后维持新肿瘤形成的能力）和多向分化（即维持其他细胞类型形成的能力，从而重建其被分离出来的亲本肿瘤的异质性细胞群体）。

已知具有“癌症干细胞”（CSC）特性的细胞群体对常规化疗中使用的多种细胞毒性药物具有优先耐药性，但支撑这一特性的分子机制仍知之甚少。在本数据集中，我们报告了通过基因表达微阵列对人类结肠癌细胞两个亚群的转录谱分析：1）具有“隐窝底部”表型的细胞（EpCAM+、CD44+、CD166+），已知该群体富含“癌症干细胞”（CSC）；2）具有“隐窝顶部”表型的细胞（EpCAM+、CD44neg、CD166neg），已知该群体在免疫缺陷小鼠异种移植后不具致瘤性。这两个细胞群体是通过荧光激活细胞分选（FACS）并行纯化获得的，起始材料为实体瘤，该实体瘤是通过将代表中度分化（G2）原发性结肠癌的患者来源异种移植（PDX）系皮下（s.c.）植入免疫缺陷小鼠而建立的。为了识别其e

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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