人类乳腺肿瘤亚型转录谱分析

源站描述说明其包含用于构建“intrinsic”基因列表的实验。数据围绕人类乳腺肿瘤亚型展开转录谱分析,可用于研究不同亚型之间的基因表达差异,并支持基于表达特征的亚型分类等分析任务(来源 omicsdi.org)

omicsdi
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基因组分类Transcriptomics
Transcription profiling of human breast tumor subtypes

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

人类乳腺肿瘤亚型转录谱分析

该数据集围绕人类乳腺肿瘤亚型开展转录谱分析,主题标签为 Transcriptomics,属于肿瘤/其他分类,来源站为 omicsdi.org。根据源站描述,该数据集包含用于构建“intrinsic”基因列表的实验。整体来看,它面向人类乳腺肿瘤不同亚型的基因表达研究,可用于观察亚型之间的表达差异,并支持基于表达特征的亚型分类等分析任务。数据集英文名称为 Transcription profiling of human breast tumor subtypes,名称本身即指向以转录水平刻画乳腺肿瘤亚型的研究方向。对于关注乳腺肿瘤分子分型、转录组表达模式以及 intrinsic 基因列表来源的研究者而言,该数据集提供了一个与上述实验相关的数据资源入口。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

该数据集的主题标签为 Transcriptomics,表明其核心数据属于转录组学范畴。数据集英文名称明确指出研究对象为人类乳腺肿瘤亚型,研究手段为转录谱分析。源站描述提到,这些实验被用于构建“intrinsic”基因列表。由此可知,该数据集与“intrinsic”基因列表的生成过程密切相关,其背景指向通过转录谱实验来识别和定义与乳腺肿瘤内在亚型相关的基因集合。本站分类将其归入肿瘤/其他,说明其在应用领域上属于肿瘤研究相关资源。

【数据内容】

依据源站描述,该数据集包含用于构建“intrinsic”基因列表的实验。数据围绕人类乳腺肿瘤亚型展开转录谱分析。其内容可用于研究不同亚型之间的基因表达差异,并支持基于表达特征的亚型分类等分析任务。主题标签为 Transcriptomics,进一步说明数据内容属于转录水平的高通量表达信息。除上述信息外,关于样本数量、平台类型、基因数量、具体亚型名称等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 omicsdi.org。源站描述为:Experiments that were used to make the "intrinsic" gene list from. 中文含义即用于构建“intrinsic”基因列表的实验。数据集英文名称为 Transcription profiling of human breast tumor subtypes。除来源站和源站描述外,关于具体采集机构、实验地点、采集时间、样本来源地区等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与人类乳腺肿瘤亚型转录谱相关的研究场景。具体而言,可用于研究不同亚型之间的基因表达差异,也可支持基于表达特征的亚型分类等分析任务。由于源站描述指出其包含用于构建“intrinsic”基因列表的实验,因此该数据集还可能适用于与 intrinsic 基因列表相关的追溯、验证或参考性分析。主题标签 Transcriptomics 表明其适用领域属于转录组学。关于更具体的适用场景,如临床诊断、预后预测、药物响应分析等,源站未提供。

【使用方法】

关于该数据集的具体使用方法,源站未提供。数据获取方式、文件格式、预处理步骤、分析流程、软件工具要求等信息,源站未提供。

【质量与限制】

关于该数据集的质量评估信息,如数据完整性、批次效应、噪声水平、验证结果等,源站未提供。关于其使用限制,如样本量限制、平台偏倚、适用范围限制等,源站未提供。本站分类为肿瘤/其他,主题标签为 Transcriptomics,来源站为 omicsdi.org,这些信息可用于初步定位,但不构成质量评价。除上述内容外,源站未提供其他质量与限制说明。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、版权归属等信息,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-SMDB-2227

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

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