垂体腺瘤肿瘤组织转录组分析:USP8突变状态与库欣病临床及诊断参数关联研究
该数据集来自 omicsdi.org,聚焦库欣病(CD)患者队列,结合临床数据评估与 USP8 第14外显子测序,并对肿瘤组织进行转录组分析,以寻找 USP8 突变状态、垂体腺瘤分子标志物与库欣综合征临床及诊断参数之间的关联,涉及激素分泌、肿瘤大小、侵袭性及 SSRT2/SSRT5 表达

基本信息
资源简介
垂体腺瘤肿瘤组织转录组分析:USP8突变状态与库欣病临床及诊断参数关联研究
该数据集来自 omicsdi.org,英文名称为“Trancriptome analysis of tumor tissue to search for the associations between USP8 mutation status, molecular markers of pituitary adenomas, and clinical, and diagnostic parametres of Cushing disease”,本站归类为肿瘤/其他,主题标签为 Transcriptomics。数据集聚焦库欣病(CD)患者队列,将临床数据评估与 USP8 第14外显子测序相结合,并对肿瘤组织开展转录组分析,旨在寻找 USP8 突变状态、垂体腺瘤分子标志物与库欣综合征临床及诊断参数之间的关联,涉及激素分泌、肿瘤大小、侵袭性以及 SSRT2/SSRT5 表达等方面。整体上,该数据集体现了以转录组学为核心、融合临床与分子检测信息的研究思路,可用于探索 USP8 突变与垂体腺瘤生物学特征及库欣病临床表现之间的联系。
【数据集背景】
该数据集围绕库欣病(Cushing disease,CD)患者队列展开。相关研究对患者队列的临床数据进行了综合评估,并对 USP8 第14外显子进行测序,以估计该队列中 USP8 突变的患病率;同时通过对肿瘤组织进行转录组分析,寻找 USP8 突变状态、垂体腺瘤分子标志物与库欣综合征临床及诊断参数之间的关联。研究所关注的临床与诊断参数包括激素分泌、肿瘤大小、侵袭性以及 SSRT2/SSRT5 表达。数据集的主题标签为 Transcriptomics,本站分类为肿瘤/其他。
【数据内容】
数据集的核心内容是肿瘤组织的转录组分析数据,并关联 USP8 突变状态、垂体腺瘤分子标志物以及库欣病相关的临床与诊断参数。具体而言,涉及的信息维度包括:USP8 第14外显子测序所反映的突变状态、垂体腺瘤的分子标志物、激素分泌情况、肿瘤大小、侵袭性,以及 SSRT2/SSRT5 表达。数据集英文名称本身即表明其目标是寻找 USP8 突变状态、垂体腺瘤分子标志物与库欣病临床及诊断参数之间的关联。除上述维度外,源站未提供更细化的数据字段、样本数量或文件构成说明。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。根据源站描述,研究工作对库欣病患者队列的临床数据进行了综合评估,并对 USP8 第14外显子进行测序,同时对肿瘤组织开展转录组分析。数据集的采集地点、采集时间、样本纳入标准及具体测序平台等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与库欣病及垂体腺瘤相关的研究场景,例如:探讨 USP8 突变状态与垂体腺瘤分子标志物之间的关系;分析 USP8 突变状态与库欣综合征临床及诊断参数(如激素分泌、肿瘤大小、侵袭性、SSRT2/SSRT5 表达)的关联;基于肿瘤组织转录组数据开展分子标志物层面的探索性分析;以及围绕 USP8 第14外显子突变患病率进行队列层面的比较研究。由于主题标签为 Transcriptomics,其典型用途还包括转录组水平的基因表达分析与关联分析。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、文件格式、分析流程、预处理步骤及配套工具等均未说明。使用者需依据 omicsdi.org 源站页面所提供的信息自行判断获取与分析方式。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量、样本规模、测序深度、缺失值情况、批次效应或验证程度等方面的说明。该数据集基于特定库欣病患者队列,其结论的外推范围受队列构成与样本条件限制;相关关联分析的结果应结合研究设计与统计方法审慎解读。除源站描述所提及的内容外,不应假定该数据集包含其他临床或分子层面的信息。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用者在引用或再利用前,应查阅 omicsdi.org 源站页面以确认相关要求。
下载信息
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无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE263206
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
在本研究中,我们综合评估了CD患者队列的临床数据,并对USP8基因第14外显子进行测序,以估计我们队列中USP8突变的患病率,同时对肿瘤组织进行转录组分析,以探寻USP8突变状态、垂体腺瘤分子标志物与库欣综合征的临床和诊断参数(包括激素分泌、肿瘤大小、侵袭性以及SSRT2/SSRT5表达)之间的关联。
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