通过抑制FACT复合物靶向治疗尤文肉瘤的ChIP-Seq数据集

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE195802

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

EWS/ETS融合转录因子，最常见的是EWSR1-FLI1，驱动尤文肉瘤（EwS）的发生和进展，这是一种高度侵袭性的儿童骨与软组织肿瘤。尽管直接靶向EWSR1-FLI1是一项艰巨的挑战，但表观遗传或转录调节因子近年来被证明是有前景的治疗靶点，可间接破坏其表达和/或功能。在此，我们进行了转录组和功能基因组学数据集分析，并结合EwS细胞系的小分子筛选，以鉴定新型表观遗传/转录靶向治疗策略。SSRP1和SUPT16H是促进染色质转录（FACT）复合体的两个亚基，二者均被发现是EwS中由EWSR1-FLI1诱导的关键致癌基因。靶向FACT的药物CBL0137在体外和体内的多种EwS临床前模型中均表现出强效的治疗效果。在机制上，FACT复合体与EWS-FLI1通过相互转录调控和激活形成致癌正反馈环路，并协同促进细胞周期/DNA复制过程及IGF1R-PI3K-AKT-mTOR通路，从而驱动EwS肿瘤发生。

FACT抑制剂药物CBL0137有效靶向EWSR1-FLI1-FACT回路，导致EWS-FLI1、SSRP1及其下游效应致癌特征的转录中断。我们的研究阐明了FACT复合体在促进EWSR1-FLI1表达和功能中的关键作用，并证明FACT抑制作为一种通过间接靶向致癌融合转录因子的新型尤文肉瘤治疗策略，为将尤文肉瘤纳入CBL0137未来临床试验提供了临床前支持。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。