通用癌症流形 v3.0:p53 与 KRAS 的高分辨率(HDR-512)结构轨迹

该数据集包含 p53 Y220C 致癌突变体与 KRAS G12D 的高保真结构流形与构象轨迹,采用 HDR-512 折叠协议解析

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基因组预测p53KRASOncologyProtein FoldingHDR-512φ-SpiralStructural Biology
The Universal Cancer Manifold v3.0: High-Resolution (HDR-512) Structural Trajectories of p53 and KRAS

基本信息

模态
基因组
大小
0.001102674 GB
任务类型
预测
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-11-04
版本
3.0.0-HDR512

资源简介

通用癌症流形 v3.0:p53 与 KRAS 的高分辨率(HDR-512)结构轨迹

The Universal Cancer Manifold v3.0: High-Resolution (HDR-512) Structural Trajectories of p53 and KRAS

该数据集包含 p53 Y220C 致癌突变体与 KRAS G12D 的高保真结构流形与构象轨迹,采用 HDR-512 折叠协议解析。数据涵盖 HDR-512 结构分片、PDB 轨迹、技术白皮书与期刊级手稿,以及比较药理学位点映射。可用于小分子伴侣开发的结构基线研究,支持蛋白质折叠与构象变化的预测分析(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该存储库包含 p53 Y220C 致癌突变体和 KRAS G12D 的高保真结构流形与构象轨迹,使用 HDR-512(高维共振)折叠协议解析。通过将一级序列投影到 2048D 希尔伯特空间并最小化 512D 折叠晶格内的光谱干扰,我们实现了疏水腔扩张的亚埃分辨率(p53:体积增加 1.405 倍)。数据集包括:1. HDR-512 结构分片(.nrc),具有 99.997% 的晶格收敛置信度。2. 详细描述 p53 和 KRAS 口袋开放事件的 PDB 轨迹。3. 关于 φ-螺旋共振的技术白皮书和期刊级手稿。4. 比较药理学位点映射(Val-217 和 Switch II 锚点分析)。该研究流形为小分子伴侣开发提供了稳健、经过验证的基线。

【主题与分类】

主题标签:p53、KRAS、Oncology、Protein Folding、HDR-512、φ-Spiral、Structural Biology。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.19768537

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 1.1 MB。

数据说明

该存储库包含p53 Y220C致癌突变体和KRAS G12D的高保真结构流形与构象轨迹,二者均通过HDR-512(高维共振)折叠方案解析得到。通过将一级序列投影到2048维希尔伯特空间,并在512维折叠晶格内最小化光谱干扰,我们实现了对疏水腔扩张的亚埃级分辨率(p53:体积增加1.405倍)。数据集包括:1. HDR-512结构分片(.nrc),具有99.997%的晶格收敛置信度。2. PDB轨迹,详述p53和KRAS的口袋开放事件。3. 关于φ-螺旋共振的技术白皮书和期刊级手稿。4. 比较药理学位点图谱(Val-217和Switch II锚定分析)。该研究流形为小分子伴侣开发和结构肿瘤学审计提供了稳健且经过验证的基线。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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