HER2突变与实体瘤免疫相关特征及免疫治疗结局的关联表
该数据为来自 figshare 的单个 CSV 表格，聚焦实体瘤中 HER2 突变与免疫相关特征及免疫检查点抑制剂治疗结局的关联
基本信息
资源简介
HER2突变与实体瘤免疫相关特征及免疫治疗结局的关联表
Table_3_Associations of HER2 Mutation With Immune-Related Features and Immunotherapy Outcomes in Solid Tumors.csv
该数据为来自 figshare 的单个 CSV 表格，聚焦实体瘤中 HER2 突变与免疫相关特征及免疫检查点抑制剂治疗结局的关联。源站描述显示，研究利用 TCGA、Asian Cancer Research Group 及江苏大学附属医院的实体瘤多组学数据，分析 HER2 突变与肿瘤微环境等特征的关系，并考察 HER2 突变经抗癌免疫影响 ICIs 疗效的可能性。数据可用于探索 HER2 突变相关的免疫特征及免疫治疗反应分析（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Targeting HER2 with Trastuzumab Deruxtecan: A Dose-Expansion, Phase I Study in Multiple Advanced Solid Tumors》发表于 Cancer Discovery（2020），DOI：10.1158/2159-8290.CD-19-1014。源站首次发布：2022-02-23。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：背景：HER2 是实体瘤中研究最广泛的癌基因之一。然而，肿瘤微环境（TME）与 HER2 突变之间的关联仍不明确，且尚无针对 HER2 突变肿瘤的特异性疗法。免疫检查点抑制剂（ICIs）已被批准用于部分缺乏靶向治疗的肿瘤亚组，但其在 HER2 突变肿瘤中的效果仍不清楚。我们通过 HER2 突变与抗癌免疫的关联，检验 HER2 突变是否影响实体瘤中 ICIs 的治疗结局。方法：使用来自 The Cancer Genome Atlas（TCGA）、Asian Cancer Research Group 和江苏大学附属医院的实体瘤多组学数据，分析 HER2 突变与肿瘤特征之间的关联。数据来自接受 ICIs（包括针对……的抗体）治疗的多发微卫星稳定实体瘤患者。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 24.37 KB。数据集 DOI：10.3389/fimmu.2022.799988.s011。
【主题与分类】
源站学科分类：Transplantation Immunology、Tumour Immunology、Immunology not elsewhere classified、Immunology、Veterinary Immunology、Animal Immunology。主题标签：immunotherapy、immune checkpoint inhibitors、HER2、tumor microenvironment、immunity。本站分类：肿瘤。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Transplantation Immunology、Tumour Immunology、Immunology not elsewhere classified、Immunology、Veterinary Immunology、Animal Immunology。
【获取与许可】
源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_3_Associations_of_HER2_Mutation_With_Immune-Related_Features_and_Immunotherapy_Outcomes_in_Solid_Tumors_csv/19219746
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Wang, Deqiang; Chen, Xiaofeng; Du, Yian; Li, Xiaoqin; Ying, Leqian; Lu, Yi; et al. (2022). Table_3_Associations of HER2 Mutation With Immune-Related Features and Immunotherapy Outcomes in Solid Tumors.csv. Frontiers. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-15，引用时请注意版本时效。
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数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Table_3_Associations of HER2 Mutation With Immune-Related Features and Immunotherapy Outcomes in Solid Tumors.csv
- DOI：10.3389/fimmu.2022.799988.s011
- 发布日期：2022-02-23
- 文件数：1 个
- 文件总体积：24.37 KB
- 源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_3_Associations_of_HER2_Mutation_With_Immune-Related_Features_and_Immunotherapy_Outcomes_in_Solid_Tumors_csv/19219746
命令行下载
curl -L -o "Table_3_Associations of HER2 Mutation With Immune-Related Features and Immunotherapy Outcomes in Solid Tumors.csv" "https://ndownloader.figshare.com/files/34141947"
文件清单
Table_3_Associations of HER2 Mutation With Immune-Related Features and Immunotherapy Outcomes in Solid Tumors.csv（24.37 KB）
文件总体积 24.37 KB（源站 API 实测）。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
数据说明
背景：HER2是实体瘤中研究最为广泛的癌基因之一。然而，肿瘤微环境（TME）与HER2突变之间的关联仍不明确，且针对HER2突变肿瘤尚无特异性疗法。免疫检查点抑制剂（ICIs）已被批准用于部分缺乏靶向治疗的肿瘤亚组，但其在HER2突变肿瘤中的疗效仍不清楚。我们通过HER2突变与抗肿瘤免疫的关联，探讨了HER2突变是否影响实体瘤中ICIs的治疗结局。方法：利用来自癌症基因组图谱（TCGA）、亚洲癌症研究组及江苏大学附属医院的实体瘤多组学数据，分析HER2突变与肿瘤特征之间的关联。收集八项研究中接受ICIs（包括抗程序性细胞死亡-1（PD-1）、程序性细胞死亡配体-1（PD-L1）或细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4（CTLA-4）抗体）治疗的多发微卫星稳定实体瘤患者数据，以探究HER2突变对免疫治疗结局的影响。
结果
HER2在TCGA实体瘤中的突变率存在差异，总体发生率为3.13%，范围从0.39%至12.2%。HER2突变与扩增共存的情况罕见（0.26%）。HER2突变与HER2蛋白表达无关，但与微卫星不稳定性、肿瘤突变负荷和新抗原负荷、浸润性抗肿瘤免疫细胞以及抗肿瘤免疫信号活性呈正相关。在321例接受ICI治疗的患者中，18例携带HER2突变（5.6%），与HER2野生型患者相比，其客观缓解率有所改善（44.4% vs. 25.7%，p=0.081），尤其在抗PD-1/抗PD-L1亚组中更为明显（62.5% vs. 28.4%，p=0.04）。不同肿瘤类型间存在异质性。HER2突变患者的总生存期也优于HER2野生型患者（HR=0.47，95%CI：0.23-0.97，p=0.04），尤其在合并ABCA1（HR=0.23，95%CI：0.07-0.73，p=0.013）、CELSR1（HR=0.24，95%CI：0.08-0.77，p=0.016）、LRP2（HR=0.24，95%CI：0.07-0.74，p=0.014）或PKHD1L1共突变时更为显著
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.3389/fimmu.2022.799988.s011（source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_3_Associations_of_HER2_Mutation_With_Immune-Related_Features_and_Immunotherapy_Outcomes_in_Solid_Tumors_csv/19219746）。
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