ST005273:运动训练与未训练小鼠CT26结直肠癌细胞非靶向代谢组学

数据覆盖源自运动训练与未训练小鼠肿瘤的原代CT26结直肠癌细胞的代谢谱,可用于比较不同运动训练状态下肿瘤细胞的代谢差异,支持代谢物特征分析与代谢通路相关研究(来源 metabolomicsworkbench.org)

University of Sao PauloUniversity of Sao Paulo
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时间序列分类LC-MS
ST005273: Untargeted metabolomics of primary CT26 colorectal cancer cells derived from tumors of exercise-trained and untrained mice

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

ST005273:运动训练与未训练小鼠CT26结直肠癌细胞非靶向代谢组学

ST005273 是一个以 LC-MS 为技术手段的非靶向代谢组学数据集,研究对象为源自运动训练与未训练小鼠肿瘤的原代 CT26 结直肠癌细胞的代谢谱。该数据集由圣保罗大学提供,物种为小鼠(Mus musculus),收录于 metabolomicsworkbench.org,本站归类为肿瘤 / 其他。其核心价值在于为比较不同运动训练状态下肿瘤细胞代谢差异提供数据基础,可支持代谢物特征分析与代谢通路相关研究。

【数据集背景】

该数据集聚焦于运动训练这一干预因素与肿瘤细胞代谢之间的关系。CT26 是小鼠结直肠癌研究中常用的细胞模型,而本数据集中的原代 CT26 结直肠癌细胞来源于运动训练小鼠与未训练小鼠的肿瘤,因此其代谢谱能够反映宿主运动状态对肿瘤细胞代谢表型的影响。数据集以非靶向代谢组学为策略,采用 LC-MS 平台进行检测,属于代谢组学研究中常见的发现型设计,适合在缺乏预设目标代谢物的情况下广泛捕捉样本中的代谢特征。源站将其归类于代谢组学研究,物种标注为小鼠,研究机构为圣保罗大学。

【数据内容】

数据内容为源自运动训练与未训练小鼠肿瘤的原代 CT26 结直肠癌细胞的代谢谱,检测方式为 LC-MS。数据集的主题标签为 LC-MS,表明液相色谱-质谱联用是其核心技术。由于是非靶向代谢组学,数据在理论上覆盖样本中可检测到的广泛代谢物信号,可用于比较两组细胞在代谢层面的差异。关于具体样本数量、分组规模、代谢物鉴定数量、色谱与质谱参数、原始数据文件格式等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 metabolomicsworkbench.org,源站描述其为一项代谢组学研究,采用 LC-MS 技术,物种为 Mus musculus,研究机构为 University of Sao Paulo(圣保罗大学)。数据集英文名中明确标注了研究对象为源自运动训练与未训练小鼠肿瘤的原代 CT26 结直肠癌细胞。除上述信息外,样本制备流程、细胞培养条件、运动训练方案、肿瘤取材方式、仪器型号与数据处理软件等实验细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于以下研究方向:比较运动训练与未训练状态下肿瘤细胞代谢谱的差异;开展代谢物特征筛选与模式识别分析;围绕差异代谢物进行代谢通路层面的关联探讨;作为结直肠癌代谢研究或运动干预相关代谢研究的参考数据。由于数据为非靶向代谢组学,也可用于方法学比较或与其他代谢组学数据集的整合分析探索。需要说明的是,这些适用方向基于数据集的主题与设计,具体分析可行性仍取决于数据本身的完整程度,源站未提供相关验证信息。

【使用方法】

使用该数据集时,可先通过 metabolomicsworkbench.org 获取数据及相关元数据,了解样本分组与检测平台信息。分析上通常包括数据预处理、归一化、差异代谢物筛选以及通路富集等步骤。由于源站未提供具体的样本量、质控设计与数据处理参数,使用前应核对源站附带的实验描述与方法信息,以确定合适的统计策略与显著性阈值。若用于跨数据集比较,需注意平台、样本类型与预处理方式的一致性。

【质量与限制】

该数据集为 LC-MS 非靶向代谢组学研究,检测结果受平台灵敏度、代谢物鉴定置信度与样本制备等因素影响,非靶向数据通常存在部分信号未能明确注释的情况。源站未提供样本量、重复数、质控样本设置、缺失值比例、鉴定等级等质量相关信息,因此无法对数据质量作出具体评价。此外,数据集仅涉及小鼠来源的原代 CT26 细胞,向其他细胞模型或人体研究的推广需谨慎。上述限制中涉及具体指标的部分,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集收录于 metabolomicsworkbench.org,使用或引用时应遵循源站的相关要求并注明数据来源。关于具体的引用格式、文献出处、许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://metabolomicsworkbench.org/data/DRCCMetadata.php?Mode=Study&StudyID=ST005273

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Metabolomics study (LC-MS). Species: Mus musculus. Institute: University of Sao Paulo.

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