小鼠肝脏蛋白质限制饮食的代谢组学变化(第一部分)

数据可用于分析蛋白质限制饮食对肝脏代谢物水平的影响,支持代谢通路与消化系统疾病相关机制的探索,并可作为代谢组学回归或差异分析建模的输入(来源 metabolomicsworkbench.org)

Monash UniversityMonash University
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蛋白质回归LC-MS
ST001346: Metabolomic changes in mouse liver on a protein restricted diet (part-I)

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

小鼠肝脏蛋白质限制饮食的代谢组学变化(第一部分)

ST001346 是一个以小鼠肝脏为研究对象、围绕蛋白质限制饮食干预展开的代谢组学数据集,英文全称为 Metabolomic changes in mouse liver on a protein restricted diet (part-I)。该数据集来自 metabolomicsworkbench.org,采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术获取代谢物层面的测量信息,物种为 Mus musculus,研究机构为 Monash University。从主题上看,它属于消化系统疾病相关分类下的“其他”方向,核心价值在于刻画蛋白质限制饮食条件下肝脏代谢物水平的变化,为代谢通路分析、差异分析以及代谢组学建模提供数据输入。整体而言,这是一个聚焦饮食营养干预与肝脏代谢响应关系的实验型代谢组学资源,适合用于探索营养因素如何通过代谢网络影响肝脏功能,并进一步关联消化系统疾病相关机制。

【数据集背景】

该数据集关注的核心问题是蛋白质限制饮食对小鼠肝脏代谢状态的影响。蛋白质是机体维持正常生理功能的重要营养素,其摄入水平的变化会引发一系列代谢适应,而肝脏作为营养代谢的中枢器官,往往是这类适应过程的关键发生部位。通过在小鼠模型中施加蛋白质限制饮食并进行肝脏代谢组学检测,研究者可以观察代谢物谱的整体改变,从而为理解营养干预与肝脏代谢调控之间的关系提供线索。数据集被归入消化系统疾病相关分类,说明其潜在应用方向与消化系统疾病机制的探索存在关联。源站描述中明确给出了研究对象为 Mus musculus、研究机构为 Monash University,以及所采用的技术路线为 LC-MS 代谢组学研究,这些信息共同界定了该数据集的基本实验背景。

【数据内容】

该数据集的内容属于代谢组学测量结果,来源于液相色谱-质谱联用分析,检测对象为小鼠肝脏组织。其主题标签为 LC-MS,表明数据以质谱代谢物检测为核心特征。数据集名称中的“part-I”提示其可能是同一研究系列中的第一部分,但关于具体分组的数量、样本量、代谢物数量、代谢物名称列表、定量矩阵结构等细节,源站未提供。数据可用于分析蛋白质限制饮食对肝脏代谢物水平的影响,支持代谢通路与消化系统疾病相关机制的探索,并可作为代谢组学回归或差异分析建模的输入。就数据组织形态而言,源站未提供更具体的说明,因此无法进一步描述其原始文件格式、预处理程度或是否包含注释信息。

【采集与来源】

该数据集来源于 metabolomicsworkbench.org,源站描述其为一项代谢组学研究,采用 LC-MS 技术,物种为 Mus musculus,研究机构为 Monash University。数据集英文名称为 ST001346: Metabolomic changes in mouse liver on a protein restricted diet (part-I)。除上述信息外,关于样本采集的具体流程、饮食干预的持续时间与配方、肝脏组织的取材与保存方式、色谱与质谱平台的具体型号、流动相与梯度条件、数据采集软件等实验细节,源站未提供。因此,该数据集在采集层面的可追溯信息主要限于技术类型、物种、研究机构与来源平台。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于以下方向:其一,分析蛋白质限制饮食对小鼠肝脏代谢物水平的影响,比较不同饮食条件下代谢物谱的差异;其二,支持代谢通路与消化系统疾病相关机制的探索,将代谢变化置于营养干预与疾病机制的框架下加以解读;其三,作为代谢组学回归分析或差异分析建模的输入数据,用于构建统计模型或机器学习模型。由于主题标签为 LC-MS,其方法学定位属于基于质谱的代谢组学,适合开展代谢物层面的定量或半定量比较研究。需要说明的是,以上适用场景均以源站描述与侧写线索所提示的方向为限,源站未提供针对特定疾病终点、特定代谢物标志物或特定通路结论的说明。

【使用方法】

该数据集可通过 metabolomicsworkbench.org 获取,具体下载方式、访问权限与文件组织方式,源站未提供。在使用层面,可将其作为代谢组学分析流程的输入,用于差异分析或回归建模等任务。由于源站未提供样本分组、代谢物注释、数据预处理状态与标准化方法等信息,实际使用前需要使用者自行确认数据的完整性与可用性。若用于跨数据集整合或比较分析,也需注意其物种为 Mus musculus、技术为 LC-MS 这一基本前提,避免与不同物种或不同检测平台的数据直接混用而产生偏差。

【质量与限制】

该数据集的来源平台为 metabolomicsworkbench.org,研究机构为 Monash University,技术类型为 LC-MS,物种为 Mus musculus,这些信息为其基本可靠性提供了背景支撑。但就质量评估而言,源站未提供样本量、重复数、缺失值比例、批次效应控制、内标使用、质控样本设置以及代谢物鉴定置信度等关键指标,因此无法对其数据质量作出具体判断。其主要限制在于:数据集名称标注为“part-I”,可能只是完整研究的一部分,单独使用时覆盖范围有限;同时,关于饮食干预方案、检测平台参数与分析流程的细节缺失,可能影响结果的可重复性与跨研究可比性。使用者应结合源站提供的原始信息自行评估适用性。

【引用与许可】

该数据集来自 metabolomicsworkbench.org,源站描述中列出的研究机构为 Monash University。关于该数据集的正式引用格式、作者列表、发表文献、DOI 以及许可协议与使用条款,源站未提供。因此,在引用或再利用该数据集时,应以 metabolomicsworkbench.org 上该条目所附的官方说明为准,并遵循来源平台的相关政策。

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使用方式

数据集获取

源站:https://metabolomicsworkbench.org/data/DRCCMetadata.php?Mode=Study&StudyID=ST001346

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Metabolomics study (LC-MS). Species: Mus musculus. Institute: Monash University.

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