ST003680:生酮饮食通过肠道微生物组长链脂肪酸硬脂酸抑制结直肠癌——CMT实验非靶向LCMS数据

这是一个编号为 ST003680 的代谢组学数据集,标题所表达的研究主题是:生酮饮食经由肠道微生物组产生的长链脂肪酸硬脂酸抑制结直肠癌,数据来自 CMT 实验的非靶向液相色谱-质谱联用(LC-MS)检测结果,收录于代谢组学工作台(metabolomicsworkbench.org),在站内被归入肿瘤

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时间序列分类LC-MS
ST003680: Ketogenic diet suppresses colorectal cancer through the gut microbiome long chain fatty acid stearate - untargeted LCMS data from CMT experiment

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

ST003680:生酮饮食通过肠道微生物组长链脂肪酸硬脂酸抑制结直肠癌——CMT实验非靶向LCMS数据

这是一个编号为 ST003680 的代谢组学数据集,标题所表达的研究主题是:生酮饮食经由肠道微生物组产生的长链脂肪酸硬脂酸抑制结直肠癌,数据来自 CMT 实验的非靶向液相色谱-质谱联用(LC-MS)检测结果,收录于代谢组学工作台(metabolomicsworkbench.org),在站内被归入肿瘤/其他类别。

【数据集背景】

从数据集标题可以看出,该研究涉及三个相互关联的要素:一是饮食干预,即生酮饮食;二是肠道微生物组及其相关的长链脂肪酸代谢产物,具体指向硬脂酸;三是结直肠癌这一肿瘤类型。整体上,这属于肿瘤代谢与肠道微生物组交叉方向的研究,试图通过代谢层面的检测来观察饮食、菌群代谢物与肿瘤之间可能存在的联系。源站描述中提到,该工作是一项代谢组学研究,采用 LC-MS 技术,实验物种为小鼠(Mus musculus),研究机构为卢森堡大学。关于研究的具体科学假设、动物模型如何构建、分组与对照设计、干预持续时间和剂量安排,以及硬脂酸与结直肠癌之间被提出的作用机制等细节,源站未提供。

【数据内容】

该数据集为非靶向 LC-MS 数据,来源于 CMT 实验。所谓非靶向,通常指在采集时不预设目标化合物清单,尽可能广泛地记录样本中可检测到的代谢信号,因而适合用于发现新的差异代谢物;而 CMT 这一实验名称的具体含义与实验条件,源站未提供。数据集包含的具体样本数量、样本类型(例如血清、粪便、组织或其他基质)、检出的代谢物数目、原始谱图文件的格式与体积、是否附带定量结果表或注释列表等信息,源站未提供。

【采集与来源】

数据的来源站点为 metabolomicsworkbench.org。依据源站描述,该研究属于代谢组学研究,检测手段为 LC-MS,实验物种为小鼠,承担机构为卢森堡大学。所使用的质谱仪器型号、色谱柱与流动相条件、梯度洗脱程序、离子化方式与正负离子采集模式、质谱分辨率与扫描范围,以及后续峰提取与比对所用的软件和数据库,源站未提供。

【适用场景】

基于上述信息,该数据集在方向上与肿瘤代谢、肠道微生物组代谢产物以及膳食干预研究相关,可用于与其他非靶向 LC-MS 代谢组数据的比较参照,或作为结直肠癌相关代谢研究的补充数据来源。由于数据集标注了 LC-MS 这一技术标签,也可能适用于代谢组学方法学层面的参考。至于该数据集被推荐用于哪些具体的分析任务、是否适合作为验证集或训练集、以及是否有配套的宿主或菌群数据可供联合分析,源站未提供。

【使用方法】

关于数据的下载方式、是否需要注册或申请权限、文件目录结构与命名规则、原始数据与处理后数据的区分、推荐的处理流程与参数设置,以及是否提供使用示例或脚本,源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量评估的信息,例如质控样本的设置、缺失值与批次效应的处理、代谢物鉴定的置信等级等。需要注意的是,该研究基于小鼠模型,属于动物实验层面的代谢组数据,若要外推到人类结直肠癌的饮食干预或临床营养实践,需要考虑物种差异、实验条件差异等通用性限制。数据集中实际存在的其他局限,源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式、文献出处、作者署名信息以及使用许可与再分发条款。如需引用或使用,建议前往来源站点查看该条目的官方说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://metabolomicsworkbench.org/data/DRCCMetadata.php?Mode=Study&StudyID=ST003680

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

代谢组学研究(LC-MS)。物种:Mus musculus。机构:University of Luxembourg。

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