空间转录组学识别成人皮肌炎中与癌症相关的免疫-基质生态位

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.15149279

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本数据集包含我们关于成人起病型皮肌炎（DM）和皮肤红斑狼疮（CLE）研究中的两个主要R数据对象：5k_paper.RDS：空间Seurat对象，包含来自17份皮肤活检的高分辨率空间转录组学数据（Xenium Prime 5K，10X Genomics），包括：12份DM皮损样本、2份CLE皮损样本、3份健康对照样本。main_obj_48samples.RDS：Seurat对象，包含来自44份皮肤活检的单细胞RNA测序数据（Chromium Single Cell Gene Expression Flex），包括：22例DM患者（皮损）、9例CLE患者（皮损）、来自部分患者的8份非皮损样本、6例健康对照。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。