空间分析揭示乳腺癌脑转移中模拟大脑的分子特征与适应性
该数据集是一个乳腺癌脑转移研究的空间转录组数据集，包含来自149名患者的235个组织核心的450个感兴趣区域的转录组谱数据，数据模态包括基因表达矩阵、临床表格和扫描图像，主要用于研究乳腺癌脑转移过程中肿瘤细胞如何通过分子模拟或适应性变化来适应脑微环境，为癌症生物学、转移机制和空间转录组学分析提供关键数据支持。
创建时间2024-12-12
更新时间2024-12-17
资源简介
该数据集为乳腺癌脑转移（BCBM）研究的空间转录组数据集合，源自Umeh Garcia等人于2024年发表的研究。数据采集自149名患者的235个组织核心，通过Nanostring GeoMx数字空间分析技术获得，共包含473个感兴趣区域（AOI）的转录组谱，经质量控制后保留450个，涵盖脑转移组织、邻近正常脑组织、原发性浸润性乳腺癌以及正常非癌脑组织。数据包括DCC计数文件、实验工作表、探针试剂盒配置文件和计数矩阵，以及经过处理的原始数据矩阵和Q3归一化数据矩阵，同时提供高分辨率数字空间分析扫描图像。该研究还引入了“等效表达指数”算法，用于识别统计学显著的“等效表达基因”，为探究乳腺癌脑转移中肿瘤细胞如何模拟或适应脑微环境提供了分子层面的数据支持，主要应用于癌症生物学、转移机制和空间转录组学研究。
提供机构：Zenodo
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