无蒂锯齿状息肉女性38岁组织图像
该数据集来自ebi.ac.uk,标题为利用Bisulphite-seq研究无蒂锯齿状腺瘤/息肉原癌CpG岛甲基化表型的数据集2,包含一名38岁女性无蒂锯齿状息肉的组织图像
![Sessile serrated polyp - Female, 38 - Tissue image [6300730028276841]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/172407.jpg)
基本信息
资源简介
无蒂锯齿状息肉女性38岁组织图像
Bisulphite-seq to investigate the proto CpG island methylator phenotype of sessile serrated adenoma/polyps, dataset 2
该数据集来自ebi.ac.uk,标题为利用Bisulphite-seq研究无蒂锯齿状腺瘤/息肉原癌CpG岛甲基化表型的数据集2,包含一名38岁女性无蒂锯齿状息肉的组织图像。源站描述显示研究对17例无蒂锯齿状腺瘤/息肉和15例传统腺瘤(均含正常黏膜匹配样本)的64份组织进行亚硫酸氢盐下一代测序,分析约270万个CpG位点的甲基化,并用RNA测序研究转录组,另用61例档案病变进行靶向验证。数据可用于表观遗传与基因表达分析(来源 BioStudies)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):背景与目的:无蒂锯齿状腺瘤/息肉(SSA/Ps)可能是约20%结肠癌的元凶,但其分子机制了解甚少。我们通过DNA甲基化和基因表达的高通量分析研究了其表观遗传表型。方法:在结肠镜检查中前瞻性收集了17例SSA/Ps以及作为对照组的15例传统腺瘤(均配有正常黏膜匹配样本)。通过亚硫酸氢盐下一代测序分析了64份组织的DNA,检测约270万个CpG位点的甲基化,这些位点主要位于跨越80.5Mb(约占基因组2.5%)的基因调控区域。还使用RNA测序研究了这些样本的转录组。使用独立的61例档案病变系列进行DNA甲基化的靶向验证。结果:SSA/Ps和传统腺瘤均显示出其深刻的重塑
【主题与分类】
主题标签:Bisulfite-seq、Homo sapiens。本站分类:肿瘤/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-6949
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- OpenDataLab:
数据说明
Mark Robinson (2018). Bisulphite-seq to investigate the proto CpG island methylator phenotype of sessile serrated adenoma/polyps, dataset 2 [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-6949
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