食管及相关样本测序数据 - Abbas 等(WGS)- 样本
该数据集为支持 Abbas 等人研究“塑造食管腺癌演化的突变特征动态”的测序数据,来源于 omicsdi.org,包含 1397 个样本的全基因组测序(WGS)数据

基本信息
资源简介
食管及相关样本测序数据 - Abbas 等(WGS)- 样本
该数据集为支持 Abbas 等人关于食管腺癌演化研究而发布的测序数据,英文名称为“Sequencing data for oesophageal and related samples - Abbas et al (WGS) - samples”,在来源站 omicsdi.org 上归类于肿瘤 / 其他类别,主题标签为 Genomics。其核心内容是围绕“塑造食管腺癌演化的突变特征动态”这一研究主题所生成的全基因组测序(WGS)数据,覆盖 1397 个样本,样本涉及食管及相关样本。该数据集的价值在于为研究食管腺癌发生发展过程中的突变特征变化提供原始测序层面的支撑材料,适合从事肿瘤基因组学、突变特征分析及食管腺癌演化研究的人员参考使用。
【数据集背景】
该数据集所支撑的研究主题为“塑造食管腺癌演化的突变特征动态”,由 Abbas 等人开展。食管腺癌是一种与突变特征累积密切相关的肿瘤类型,理解其演化过程中的突变特征动态,有助于揭示肿瘤发生发展的基因组学机制。该数据集正是为该项研究提供全基因组测序层面的数据支撑而发布,属于肿瘤基因组学领域中与食管腺癌演化研究直接相关的测序数据资源。在来源站 omicsdi.org 的分类体系中,该数据集被归入肿瘤 / 其他类别,主题标签为 Genomics,体现了其以基因组测序数据为核心内容、服务于肿瘤研究的定位。
【数据内容】
该数据集包含 1397 个样本的全基因组测序(WGS)数据,样本类型为食管及相关样本。数据内容围绕全基因组测序展开,属于基因组学范畴的测序数据。源站描述明确指出这些数据用于支持 Abbas 等人关于食管腺癌突变特征动态的研究,因此数据内容在整体上服务于突变特征识别与演化分析这一研究目标。除上述样本数量、测序类型与样本范围外,源站未提供关于数据文件格式、数据量大小、测序深度、覆盖度等更细化的技术参数。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。源站描述表明,这些数据是为支持 Abbas 等人题为“Mutational signature dynamics shaping the evolution of oesophageal adenocarcinoma”的研究而提供的全基因组测序数据,覆盖 1397 个样本。关于样本的具体采集地点、采集时间、伦理审批信息以及测序平台等细节,源站未提供。
【适用场景】
基于其内容与来源,该数据集适用于食管腺癌演化相关的突变特征动态研究,可作为全基因组测序层面的数据支撑材料,用于围绕食管及相关样本开展基因组学分析。其主题标签为 Genomics,分类归属为肿瘤 / 其他,因此也适合作为肿瘤基因组学研究中与突变特征分析相关的参考数据。关于该数据集在其他具体分析场景中的适用性,源站未提供进一步说明。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据获取方式、文件组织方式、分析流程或配套工具等信息。
【质量与限制】
源站未提供关于该数据集质量评估、质控指标或使用限制的说明。已知信息仅包括其为支持 Abbas 等人研究而发布的全基因组测序数据,覆盖 1397 个样本,样本为食管及相关样本。使用者在缺乏源站进一步说明的情况下,需自行评估数据是否满足其研究需求。
【引用与许可】
该数据集对应的研究成果为 Abbas 等人的“Mutational signature dynamics shaping the evolution of oesophageal adenocarcinoma”。关于该数据集的许可条款与具体引用格式,源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001011196
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Data supporting: “Mutational signature dynamics shaping the evolution of oesophageal adenocarcinoma” Abbas et al (WGS for 1397 samples)
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