肉瘤感兴趣区域(ROI)图像 - 第5部分
该数据集为骨与软组织(BST)肿瘤的感兴趣区域(ROI)图像,属于 PAIR-BST 数据集的一部分。PAIR-BST 包含来自 268 名 BST 肿瘤患者的 470 张全切片图像中提取的 2,252 个经病理学家标注的 ROI,每个 ROI 带有多级标签,涵盖 33 种组织学诊断、11 种分化谱

基本信息
资源简介
肉瘤感兴趣区域(ROI)图像 - 第5部分
Sarcoma Region of Interest (ROI) Images - Part 5
该数据集为骨与软组织(BST)肿瘤的感兴趣区域(ROI)图像,属于 PAIR-BST 数据集的一部分。PAIR-BST 包含来自 268 名 BST 肿瘤患者的 470 张全切片图像中提取的 2,252 个经病理学家标注的 ROI,每个 ROI 带有多级标签,涵盖 33 种组织学诊断、11 种分化谱系和 6 种生长模式。本部分提供 400 个 PNG 格式的 ROI 图像文件,可用于肿瘤形态特征研究、多标签图像分类与基准评测(来源 figshare,CC BY-NC 4.0 许可)。
【数据集背景】
项目资助方:This study was supported by a grant from the National R&D Program for Cancer Control, Ministry of Health & Welfare, Republic of Korea (grant number: RS-2023-CC138390). This study was supported by the Korea Health Industry Development Institute (KHIDI) under the project “Establishment of Real-World Evidence and Technology Development for Precision Medicine Based on targeted NGS Data” (grant number: RS-2025-22842969/RS-2025-22852970).。源站首次发布:2026-09-01。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):骨与软组织(BST)肿瘤是一组异质性且罕见的间叶性肿瘤,由于其复杂的形态和重叠的组织学特征,诊断面临重大挑战。尽管数字病理学发展迅速,但大多数公开数据集主要关注常见的上皮性肿瘤,对 BST 肿瘤的代表性有限。为填补这一空白,我们推出了病理学家标注的骨与软组织肿瘤图像检索数据集(PAIR-BST),该数据集由 2,252 个经病理学家标注的感兴趣区域组成,这些区域取自 268 名确诊为 BST 肿瘤患者的 470 张全切片图像。每个区域均经过整理并标注了多级标签,包括 33 种组织学诊断、11 种分化谱系和 6 种生长模式,从而能够全面表征形态异质性。
【数据结构与技术规格】
文件数 400 个,合计 13.80 GB。数据集 DOI:10.25452/figshare.plus.33351292.v1。
【主题与分类】
源站学科分类:Solid tumours、Pathology (excl. oral pathology)、Applications in health、Artificial intelligence not elsewhere classified、Computer vision。主题标签:Digital pathology、Anatomic pathology、Bone and soft tissue tumors、Benchmark dataset、Multilabel image dataset。本站分类:肿瘤。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Solid tumours、Pathology (excl. oral pathology)、Applications in health、Artificial intelligence not elsewhere classified、Computer vision。
【获取与许可】
源站页面:https://plus.figshare.com/articles/dataset/Sarcoma_Region_of_Interest_ROI_Images_-_Part_5/33351292
使用许可:CC BY-NC 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/)。
规范引用:Choi, Yoon-La; Ho, David Joon; Jung, Kyu-Hwan; Jeon, Yongjun; Jeong, Hoyeon; Kim, Gyu Yeong; et al. (2026). Sarcoma Region of Interest (ROI) Images - Part 5. Figshare+. Dataset
下载信息
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数据集获取(Figshare)
- 源站标题:Sarcoma Region of Interest (ROI) Images - Part 5
- DOI:10.25452/figshare.plus.33351292.v1
- 发布日期:2026-09-01
- 文件数:400 个
- 文件总体积:13.80 GB
- 源站页面:https://plus.figshare.com/articles/dataset/Sarcoma_Region_of_Interest_ROI_Images_-_Part_5/33351292
命令行下载
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文件清单
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文件总体积 13.80 GB(源站 API 实测)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
骨与软组织(BST)肿瘤是一组异质性且罕见的间叶性肿瘤,由于其形态复杂且组织学特征存在重叠,给诊断带来了重大挑战。尽管数字病理学发展迅速,但大多数公开可用的数据集主要集中于常见的上皮性肿瘤,对BST肿瘤的代表性有限。为弥补这一空白,我们推出了骨与软组织肿瘤病理学家标注图像检索数据集(PAIR-BST),该数据集包含2,252个由病理学家标注的感兴趣区域,来源于268例确诊为BST肿瘤患者的470张全切片图像。每个区域均经过整理并标注了多级标签,包括33种组织学诊断、11种分化谱系和6种生长模式,从而能够全面表征BST肿瘤固有的形态学异质性。基准实验表明,病理学基础模型在识别这些肿瘤方面面临挑战,尤其是在区分肿瘤亚型和生长模式时。
PAIR-BST为病理学基础模型的开发与评估提供了一个高质量、具有判别力的基准,特别聚焦于罕见的间叶性肿瘤。[元数据可用性] 包含WSI内所有ROI(感兴趣区域)具体坐标的附加元数据,以及每个ROI的诊断等标签,可在以下链接的单独.csv文件中获取:https://doi.org/10.25452/figshare.plus.33383509(相关材料中亦有链接)。可在以下集合中查找相关数据集:https://doi.org/10.25452/figshare.plus.c.8223469
许可
CC BY-NC 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.25452/figshare.plus.33351292.v1(source: https://plus.figshare.com/articles/dataset/Sarcoma_Region_of_Interest_ROI_Images_-_Part_5/33351292)。
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