肉瘤感兴趣区域(ROI)图像 - 第4部分
该数据集为骨与软组织肿瘤感兴趣区域图像的第4部分,来源于figshare,共包含400个PNG格式的ROI图像文件。图像源自PAIR-BST数据集,该数据集由病理学家标注,涵盖33种组织学诊断、11种分化谱系和6种生长模式等多层级标签

基本信息
资源简介
肉瘤感兴趣区域(ROI)图像 - 第4部分
Sarcoma Region of Interest (ROI) Images - Part 4
该数据集为骨与软组织肿瘤感兴趣区域图像的第4部分,来源于figshare,共包含400个PNG格式的ROI图像文件。图像源自PAIR-BST数据集,该数据集由病理学家标注,涵盖33种组织学诊断、11种分化谱系和6种生长模式等多层级标签。这些数据可用于骨与软组织肿瘤的形态学特征研究、多标签图像分类模型的训练与基准评测,弥补公开数据集中此类罕见肿瘤代表性不足的问题(来源 figshare,CC BY-NC 4.0 许可)。
【数据集背景】
项目资助方:This study was supported by a grant from the National R&D Program for Cancer Control, Ministry of Health & Welfare, Republic of Korea (grant number: RS-2023-CC138390). This study was supported by the Korea Health Industry Development Institute (KHIDI) under the project “Establishment of Real-World Evidence and Technology Development for Precision Medicine Based on targeted NGS Data” (grant number: RS-2025-22842969/RS-2025-22852970).。源站首次发布:2026-09-01。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):骨与软组织(BST)肿瘤是一组异质性且罕见的间叶性肿瘤,由于其复杂的形态和重叠的组织学特征,诊断面临重大挑战。尽管数字病理学发展迅速,但大多数公开数据集主要关注常见的上皮性肿瘤,对BST肿瘤的代表性有限。为弥补这一空白,我们推出了用于骨与软组织肿瘤的病理学家标注图像检索数据集(PAIR-BST),该数据集包含2,252个由病理学家标注的感兴趣区域,源自268名确诊BST肿瘤患者的470张全切片图像。每个区域均经过整理并标注了多层级标签,包括33种组织学诊断、11种分化谱系和6种生长模式,从而能够全面表征形态学异质性
【数据结构与技术规格】
文件数 400 个,合计 14.02 GB。数据集 DOI:10.25452/figshare.plus.33351112.v1。
【主题与分类】
源站学科分类:Solid tumours、Pathology (excl. oral pathology)、Applications in health、Artificial intelligence not elsewhere classified、Computer vision。主题标签:Digital pathology、Anatomic pathology、Bone and soft tissue tumors、Benchmark dataset、Multilabel image dataset。本站分类:肿瘤。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Solid tumours、Pathology (excl. oral pathology)、Applications in health、Artificial intelligence not elsewhere classified、Computer vision。
【获取与许可】
源站页面:https://plus.figshare.com/articles/dataset/Sarcoma_Region_of_Interest_ROI_Images_-_Part_4/33351112
使用许可:CC BY-NC 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/)。
规范引用:Choi, Yoon-La; Ho, David Joon; Jung, Kyu-Hwan; Jeon, Yongjun; Jeong, Hoyeon; Kim, Gyu Yeong; et al. (2026). Sarcoma Region of Interest (ROI) Images - Part 4. Figshare+. Dataset
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使用方式
数据集获取(Figshare)
- 源站标题:Sarcoma Region of Interest (ROI) Images - Part 4
- DOI:10.25452/figshare.plus.33351112.v1
- 发布日期:2026-09-01
- 文件数:400 个
- 文件总体积:14.02 GB
- 源站页面:https://plus.figshare.com/articles/dataset/Sarcoma_Region_of_Interest_ROI_Images_-_Part_4/33351112
命令行下载
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文件清单
0223a3eb-c98f-4686-8a33-57ad0219af43_roi_1.png(30.44 MB)0223a3eb-c98f-4686-8a33-57ad0219af43_roi_2.png(25.45 MB)0223a3eb-c98f-4686-8a33-57ad0219af43_roi_3.png(22.90 MB)0223a3eb-c98f-4686-8a33-57ad0219af43_roi_4.png(29.49 MB)0223a3eb-c98f-4686-8a33-57ad0219af43_roi_5.png(24.97 MB)02729813-bb48-4703-89c4-85334d3e2b87_roi_1.png(34.36 MB)02729813-bb48-4703-89c4-85334d3e2b87_roi_2.png(35.36 MB)02729813-bb48-4703-89c4-85334d3e2b87_roi_3.png(38.03 MB)02729813-bb48-4703-89c4-85334d3e2b87_roi_4.png(38.38 MB)02729813-bb48-4703-89c4-85334d3e2b87_roi_5.png(36.63 MB)0560b8c0-9205-45d7-b9ea-183705b0c20f_roi_1.png(38.01 MB)0560b8c0-9205-45d7-b9ea-183705b0c20f_roi_2.png(37.46 MB)0560b8c0-9205-45d7-b9ea-183705b0c20f_roi_3.png(38.60 MB)0560b8c0-9205-45d7-b9ea-183705b0c20f_roi_4.png(36.78 MB)0560b8c0-9205-45d7-b9ea-183705b0c20f_roi_5.png(37.64 MB)06349596-1c9f-4018-a62f-9706f7cf0480_roi_1.png(35.09 MB)06349596-1c9f-4018-a62f-9706f7cf0480_roi_2.png(35.88 MB)06349596-1c9f-4018-a62f-9706f7cf0480_roi_3.png(36.56 MB)06349596-1c9f-4018-a62f-9706f7cf0480_roi_4.png(37.60 MB)06349596-1c9f-4018-a62f-9706f7cf0480_roi_5.png(37.60 MB)
文件总体积 14.02 GB(源站 API 实测)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
骨与软组织(BST)肿瘤是一组异质性且罕见的间叶性肿瘤,由于其形态复杂且组织学特征存在重叠,给诊断带来了重大挑战。尽管数字病理学发展迅速,但大多数公开可用的数据集主要集中于常见的上皮性肿瘤,对BST肿瘤的代表性有限。为弥补这一空白,我们推出了骨与软组织肿瘤病理学家标注图像检索数据集(PAIR-BST),该数据集包含2,252个由病理学家标注的感兴趣区域,来源于268例确诊为BST肿瘤患者的470张全切片图像。每个区域均经过整理并标注了多级标签,包括33种组织学诊断、11种分化谱系和6种生长模式,从而能够全面表征BST肿瘤固有的形态学异质性。基准实验表明,病理学基础模型在识别这些肿瘤方面面临挑战,尤其是在区分肿瘤亚型和生长模式时。
PAIR-BST为病理学基础模型的开发与评估提供了一个高质量、具有判别力的基准,特别聚焦于罕见的间叶性肿瘤。[元数据可用性] 包含WSI内所有ROI(感兴趣区域)具体坐标的附加元数据,以及每个ROI的诊断等标签,可在以下链接的单独.csv文件中获取:https://doi.org/10.25452/figshare.plus.33383509(相关材料中亦有链接)。可在以下集合中查找相关数据集:https://doi.org/10.25452/figshare.plus.c.8223469
许可
CC BY-NC 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.25452/figshare.plus.33351112.v1(source: https://plus.figshare.com/articles/dataset/Sarcoma_Region_of_Interest_ROI_Images_-_Part_4/33351112)。
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