肉瘤感兴趣区域(ROI)图像 - 第2部分

该数据集为骨与软组织(BST)肿瘤的感兴趣区域(ROI)图像,来源于figshare,共400个PNG文件,文件命名以病例标识加roi序号构成

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2026-09-01 更新
浏览 2
图像分类Digital pathologyAnatomic pathologyBone and soft tissue tumorsBenchmark datasetMultilabel image dataset
Sarcoma Region of Interest (ROI) Images - Part 2

基本信息

模态
图像
大小
14.029357732 GB
任务类型
分类
许可
CC BY-NC 4.0
创建/更新时间
2026-09-01
版本
v1

资源简介

肉瘤感兴趣区域(ROI)图像 - 第2部分

Sarcoma Region of Interest (ROI) Images - Part 2

该数据集为骨与软组织(BST)肿瘤的感兴趣区域(ROI)图像,来源于figshare,共400个PNG文件,文件命名以病例标识加roi序号构成。数据面向数字病理场景,覆盖骨与软组织肿瘤的形态学区域,可用于构建和评估多标签图像分类、图像检索等基准任务,帮助弥补公开数据集中骨与软组织肿瘤代表性不足的问题(来源 figshare,CC BY-NC 4.0 许可)。

【数据集背景】

项目资助方:This study was supported by a grant from the National R&D Program for Cancer Control, Ministry of Health & Welfare, Republic of Korea (grant number: RS-2023-CC138390). This study was supported by the Korea Health Industry Development Institute (KHIDI) under the project “Establishment of Real-World Evidence and Technology Development for Precision Medicine Based on targeted NGS Data” (grant number: RS-2025-22842969/RS-2025-22852970).。源站首次发布:2026-09-01。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):骨与软组织(BST)肿瘤是一组异质性且罕见的间叶性肿瘤,由于其形态复杂且组织学特征重叠,给诊断带来重大挑战。尽管数字病理学发展迅速,但大多数公开数据集主要关注常见的上皮性肿瘤,对BST肿瘤的代表性有限。为填补这一空白,我们推出了骨与软组织肿瘤病理学家标注图像检索数据集(PAIR-BST),该数据集由2,252个病理学家标注的感兴趣区域组成,这些区域取自268名确诊BST肿瘤患者的470张全切片图像。每个区域均经过整理并标注了多级标签,包括33种组织学诊断、11种分化方向和6种生长模式,从而能够对形态异质性进行全面表征

【数据结构与技术规格】

文件数 400 个,合计 14.03 GB。数据集 DOI:10.25452/figshare.plus.33350781.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Solid tumours、Pathology (excl. oral pathology)、Applications in health、Artificial intelligence not elsewhere classified、Computer vision。主题标签:Digital pathology、Anatomic pathology、Bone and soft tissue tumors、Benchmark dataset、Multilabel image dataset。本站分类:肿瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Solid tumours、Pathology (excl. oral pathology)、Applications in health、Artificial intelligence not elsewhere classified、Computer vision。

【获取与许可】

源站页面:https://plus.figshare.com/articles/dataset/Sarcoma_Region_of_Interest_ROI_Images_-_Part_2/33350781

使用许可:CC BY-NC 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/)。

规范引用:Choi, Yoon-La; Ho, David Joon; Jung, Kyu-Hwan; Jeon, Yongjun; Jeong, Hoyeon; Kim, Gyu Yeong; et al. (2026). Sarcoma Region of Interest (ROI) Images - Part 2. Figshare+. Dataset

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数据集获取(Figshare)

命令行下载

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文件清单

  • 05378b0b-6976-4322-8112-e667d69c15d5_roi_1.png(37.85 MB)
  • 05378b0b-6976-4322-8112-e667d69c15d5_roi_2.png(37.63 MB)
  • 05378b0b-6976-4322-8112-e667d69c15d5_roi_3.png(37.91 MB)
  • 05378b0b-6976-4322-8112-e667d69c15d5_roi_4.png(38.85 MB)
  • 05378b0b-6976-4322-8112-e667d69c15d5_roi_5.png(38.58 MB)
  • 0a73fc22-206d-4344-9fb7-51aa0bbc2c27_roi_1.png(32.63 MB)
  • 0a73fc22-206d-4344-9fb7-51aa0bbc2c27_roi_2.png(30.47 MB)
  • 0a73fc22-206d-4344-9fb7-51aa0bbc2c27_roi_3.png(33.51 MB)
  • 0a73fc22-206d-4344-9fb7-51aa0bbc2c27_roi_4.png(36.37 MB)
  • 0a73fc22-206d-4344-9fb7-51aa0bbc2c27_roi_5.png(33.05 MB)
  • 0ccbc53d-25f5-4bf5-a1a2-3034f35a7577_roi_1.png(36.85 MB)
  • 0ccbc53d-25f5-4bf5-a1a2-3034f35a7577_roi_2.png(37.78 MB)
  • 0ccbc53d-25f5-4bf5-a1a2-3034f35a7577_roi_3.png(37.79 MB)
  • 0ccbc53d-25f5-4bf5-a1a2-3034f35a7577_roi_4.png(37.43 MB)
  • 0ccbc53d-25f5-4bf5-a1a2-3034f35a7577_roi_5.png(36.92 MB)
  • 0d1e847b-d642-486b-afaa-a4ce4671a5ff_roi_1.png(36.57 MB)
  • 0d1e847b-d642-486b-afaa-a4ce4671a5ff_roi_2.png(36.11 MB)
  • 0d1e847b-d642-486b-afaa-a4ce4671a5ff_roi_3.png(34.98 MB)
  • 0d1e847b-d642-486b-afaa-a4ce4671a5ff_roi_4.png(37.47 MB)
  • 0d1e847b-d642-486b-afaa-a4ce4671a5ff_roi_5.png(37.76 MB)

文件总体积 14.03 GB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

骨与软组织(BST)肿瘤是一组异质性且罕见的间叶性肿瘤,由于其形态复杂且组织学特征存在重叠,给诊断带来了重大挑战。尽管数字病理学发展迅速,但大多数公开可用的数据集主要集中于常见的上皮性肿瘤,对BST肿瘤的代表性有限。为弥补这一空白,我们推出了骨与软组织肿瘤病理学家标注图像检索数据集(PAIR-BST),该数据集包含2,252个由病理学家标注的感兴趣区域,来源于268例确诊为BST肿瘤患者的470张全切片图像。每个区域均经过整理并标注了多级标签,包括33种组织学诊断、11种分化谱系和6种生长模式,从而能够全面表征BST肿瘤固有的形态学异质性。基准实验表明,病理学基础模型在识别这些肿瘤方面面临挑战,尤其是在区分肿瘤亚型和生长模式时。

PAIR-BST为病理学基础模型的开发与评估提供了一个高质量、具有判别力的基准,特别聚焦于罕见的间叶性肿瘤。[元数据可用性] 包含WSI内所有ROI(感兴趣区域)具体坐标的附加元数据,以及每个ROI的诊断等标签,可在以下链接的单独.csv文件中获取:https://doi.org/10.25452/figshare.plus.33383509(相关材料中亦有链接)。可在以下集合中查找相关数据集:https://doi.org/10.25452/figshare.plus.c.8223469

许可

CC BY-NC 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.25452/figshare.plus.33350781.v1(source: https://plus.figshare.com/articles/dataset/Sarcoma_Region_of_Interest_ROI_Images_-_Part_2/33350781)。

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