Ewing肉瘤蛋白对外显子定义与凋亡的调控
该数据集来自omicsdi.org，包含HeLa细胞转染scrambled或siEWS寡核苷酸后三个生物学重复的表达数据，用于鉴定EWS的体内RNA靶标
基本信息
资源简介
Ewing肉瘤蛋白对外显子定义与凋亡的调控
该数据集来自omicsdi.org，包含HeLa细胞转染scrambled或siEWS寡核苷酸后三个生物学重复的表达数据，用于鉴定EWS的体内RNA靶标。数据可支持分析EWS敲低对基因表达和可变剪接的影响，源站描述提及805个基因表达受影响（395上调、410下调），以及HJAY鉴定的114个基因中206个差异调控的可变剪接事件（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：Ewing肉瘤蛋白EWS属于RNA和DNA结合蛋白的TET家族（FUS/TLS、EWS、TAF15），参与DNA转录、pre-mRNA剪接和基因组完整性维持。为了鉴定EWS的体内RNA靶标，我们采用了CLIP-Seq的组合方法。在本数据集中，我们纳入了转染scrambled或siEWS寡核苷酸的HeLa细胞三个生物学重复获得的表达数据。这些数据使我们能够鉴定出805个受EWS敲低影响表达水平的基因，其中395个上调、410个下调。此外，HJAY在114个基因中鉴定出206个差异调控的可变剪接事件。三个生物学重复被标记并杂交到Affymetrix HJAY上。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-47790
下载信息
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数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-47790
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
尤文肉瘤蛋白EWS属于RNA和DNA结合蛋白的TET家族（FUS/TLS、EWS、TAF15），参与DNA转录、前体mRNA剪接及基因组完整性的维持。为鉴定EWS在体内的RNA靶标，我们采用CLIP-Seq的组合方法。在本数据集中，我们纳入了转染乱序或siEWS寡核苷酸的HeLa细胞三个生物学重复所获得的表达数据。这些数据使我们能够鉴定出805个受EWS敲低影响表达水平的基因，其中395个上调，410个下调。此外，HJAY在114个基因中鉴定出206个差异调控的可变剪接事件。三个生物学重复被标记并杂交到Affymetrix HJAY芯片上。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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