成人皮肌炎空间转录组与单细胞RNA测序原始数据
该数据集包含来自成人皮肌炎（DM）、皮肤红斑狼疮（CLE）患者及健康对照的皮肤活检的空间转录组和单细胞RNA测序原始输出文件，支持我们的研究“空间转录组识别成人皮肌炎中与癌症相关的免疫-基质生态位”
基本信息
资源简介
成人皮肌炎空间转录组与单细胞RNA测序原始数据
该数据集包含来自成人皮肌炎（DM）、皮肤红斑狼疮（CLE）患者及健康对照的皮肤活检的空间转录组和单细胞RNA测序原始输出文件，支持我们的研究“空间转录组识别成人皮肌炎中与癌症相关的免疫-基质生态位”
Raw Xenium Prime 5K and Chromium Flex output for: "Spatial Transcriptomics Identifies Immune-Stromal Niches Associated with Cancer in Adult Dermatomyositis"
【数据集背景】
源站首次发布：2026。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：该数据集包含来自成人皮肌炎（DM）、皮肤红斑狼疮（CLE）患者及健康对照的皮肤活检的空间转录组和单细胞RNA测序原始输出文件，支持我们的研究“空间转录组识别成人皮肌炎中与癌症相关的免疫-基质生态位”。数据以两个压缩档案提供。每个样本存储在其自己的子文件夹中。每个样本文件夹包含标准的Xenium输出。raw_spatial_output.zip — 来自Xenium分析仪的Xenium Prime 5K（10x Genomics）原始输出，涵盖19例皮肤活检：12例DM皮损样本、4例CLE皮损样本、3例健康对照样本。raw_flex.zip — 来自cellranger的Chromium单细胞基因表达Flex（10x Genomics）过滤特征-条形码矩阵，涵盖44例皮肤活检：22例DM皮损样本、9例CLE皮损样本、8例非皮损样本。
【主题与分类】
主题标签：空间转录组、单细胞RNA测序、皮肌炎、皮肤活检、Xenium、Chromium Flex、肿瘤。本站分类：肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.20388043
使用许可：Creative Commons Attribution 4.0 International。
下载信息
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源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.20388043
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pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 13.94 GB。
数据说明
该数据集包含来自成人皮肌炎（DM）、皮肤红斑狼疮（CLE）患者及健康对照者皮肤活检的空间转录组学和单细胞RNA测序原始输出文件，支持我们的研究《空间转录组学识别与成人皮肌炎癌症相关的免疫-基质生态位》。数据以两个压缩档案提供。每个样本存储在其各自的子文件夹中。每个样本文件夹包含标准的Xenium输出。raw_spatial_output.zip — 来自Xenium分析仪的Xenium Prime 5K（10x Genomics）原始输出，涵盖19份皮肤活检：12份DM皮损样本、4份CLE皮损样本、3份健康对照样本。raw_flex.zip — 来自cellranger的Chromium单细胞基因表达Flex（10x Genomics）过滤特征-条形码矩阵，涵盖44份皮肤活检：22份DM皮损样本、9份CLE皮损样本、来自部分患者的8份非皮损样本、6份健康对照。每个样本文件夹包含标准的10x矩阵输出（sample_filtered_feature_bc_matrix/）：barcodes.tsv.gz — 细胞条形码；features.tsv.gz — 基因ID和符号；matrix.mtx.gz — 稀疏细胞×基因计数矩阵。
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