鼻咽癌分子生物标志物与空间转录组学前瞻性研究

该数据集来自 clinicaltrials.gov 的前瞻性观察研究,聚焦鼻咽癌患者。研究采集患者入组时、放疗完成10、20、32次时、放疗后3个月及疾病进展时的全血样本,以及入组时和疾病进展时的肿瘤组织标本,用于生物标志物与空间转录组学分析,并与主要病理缓解、无进展生存、总生存和肿瘤反应等临床结局

Jiangsu Cancer Institute & HospitalJiangsu Cancer Institute & Hospital
clinicaltrials
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基因组预测Nasopharyngeal Carcinoma
Prospective Study for Molecular Biomarkers and Spatial Transcriptomics of Nasopharyngeal Carcinoma

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-31

资源简介

鼻咽癌分子生物标志物与空间转录组学前瞻性研究

该数据集对应一项在 clinicaltrials.gov 登记的前瞻性观察研究,英文名称为 Prospective Study for Molecular Biomarkers and Spatial Transcriptomics of Nasopharyngeal Carcinoma,聚焦鼻咽癌(Nasopharyngeal Carcinoma)患者。研究围绕诱导化疗与同步放化疗过程中的样本采集展开,获取患者入组时、放疗完成10、20、32次时、放疗后3个月及疾病进展时的全血样本,以及入组时和疾病进展时的肿瘤组织标本,用于生物标志物与空间转录组学分析,并将分析结果与主要病理缓解、无进展生存、总生存和肿瘤反应等临床结局相关联。本站将其归入肿瘤/其他分类,主题标签为鼻咽癌。

【数据集背景】

该数据集来源于 clinicaltrials.gov 登记的一项前瞻性观察研究,研究对象为鼻咽癌患者。研究的主要终点为评估鼻咽癌患者的主要病理缓解,次要终点为评估鼻咽癌患者的无失败生存与总生存。研究设计为前瞻性观察性研究,患者在研究期间接受诱导化疗和同步放化疗。研究的核心思路是将分子生物标志物与空间转录组学信息同临床结局建立关联,以支持对鼻咽癌治疗反应和生存结局的深入理解。

【数据内容】

数据集涵盖的样本类型包括全血样本与肿瘤组织标本。全血样本的采集时点为患者入组时、完成10次放疗时、完成20次放疗时、完成32次放疗时、放疗后3个月以及疾病进展时。肿瘤组织标本的采集时点为患者入组时和疾病进展时。样本用于生物标志物分析与空间转录组学分析。与样本分析相对应的临床结局信息包括主要病理缓解、无进展生存、总生存和肿瘤反应。上述内容构成了该数据集在样本维度、时间维度与分析维度上的基本框架。

【采集与来源】

数据来源为 clinicaltrials.gov 登记的前瞻性观察研究。采集对象为鼻咽癌患者,采集过程嵌入患者接受诱导化疗与同步放化疗的临床路径之中,全血样本按入组时、放疗完成10、20、32次时、放疗后3个月及疾病进展时多个时点重复获取,肿瘤组织标本则在入组时与疾病进展时获取。样本后续用于生物标志物与空间转录组学分析,分析结果与临床结局进行关联。除上述来源与采集安排外,源站未提供更细化的采集机构、采集流程或检测平台信息。

【适用场景】

该数据集适用于鼻咽癌相关的转化研究与临床研究场景,尤其是围绕生物标志物与空间转录组学同治疗反应及生存结局关联的探索性分析。由于研究设置了主要病理缓解这一主要终点以及无失败生存与总生存等次要终点,数据可用于考察分子层面特征与病理缓解、生存结局之间的对应关系。多时点全血采样与入组时、疾病进展时的组织采样,也使其适用于分析治疗过程中与疾病进展过程中的分子变化。具体适用分析类型需以源站提供的信息为限。

【使用方法】

使用该数据集时,可按照样本类型与采集时点组织分析:以全血样本的纵向系列考察治疗期间及放疗后、疾病进展时的生物标志物变化;以肿瘤组织标本考察入组时与疾病进展时的生物标志物与空间转录组学特征;再将上述分析结果与主要病理缓解、无进展生存、总生存和肿瘤反应等临床结局进行关联。研究为前瞻性观察设计,分析时应尊重其观察性属性。源站未提供具体的数据访问方式、文件格式或分析流程说明。

【质量与限制】

该研究为前瞻性观察研究,主要终点与次要终点定义明确,采样时点设置较为系统,这是其设计上的特点。同时,源站未提供样本量、缺失数据处理、检测方法细节、随访时长以及质量控制措施等信息,相关质量评估无法据此展开。此外,源站描述在肿瘤反应部分存在截断,相关表述不完整。使用时应以源站登记的完整信息为准,并注意观察性研究在因果推断上的固有边界。

【引用与许可】

源站未提供引用格式与许可条款信息。使用该数据集或引用相关研究时,应查阅 clinicaltrials.gov 上该研究的登记页面以获取正式的引用与使用要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT05912582

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件:鼻咽癌。主要终点:评估鼻咽癌患者的主要病理缓解情况。次要终点:评估鼻咽癌患者的无失败生存期和总生存期。研究概要:这是一项前瞻性观察性研究。鼻咽癌患者接受诱导化疗和同步放化疗。在患者入组时、完成10、20、32次放射治疗时、放射治疗后3个月以及疾病进展时采集患者全血。在患者入组时和疾病进展时采集肿瘤组织标本。对样本进行生物标志物和空间转录组学分析。将生物标志物和空间转录组学与临床结局(主要病理缓解、无进展生存期、总生存期、肿瘤治疗反应、远处转移、复发和死亡)进行相关性分析。该分析旨在探索潜在的生物标志物,并验证分子特征在鼻咽癌中的预测和预后价值。

这将有助于确定风险分组和患者分层,进而推动鼻咽癌的精准医疗。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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