PRJNA294157：库欣病中微腺瘤与大腺瘤的差异表达分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE246211

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

由垂体腺瘤引起的ACTH依赖性皮质醇增多症[库欣病（CD）]是内源性库欣综合征最常见的病因。CD常伴随多种并发症，包括高血压、糖尿病、骨质疏松/骨折、继发感染以及心血管死亡率增加。虽然在垂体磁共振成像上可见的促肾上腺皮质激素腺瘤中大多数（约80%）为微腺瘤（MIC，直径<10 mm），但部分肿瘤为大腺瘤（MAC，≥10 mm），具有更强的生长潜力和侵袭性，极少数甚至表现出恶性行为。此外，较大且具有侵袭性的MAC与局部并发症（如垂体功能减退和视野缺损）风险显著增加相关。鉴于促肾上腺皮质激素腺瘤在临床和分子层面的异质性，本研究旨在探讨MIC与MAC之间的基因差异表达模式，并将侵袭程度作为肿瘤分类的标准之一。

本研究纳入了经临床、实验室、影像学及组织病理学诊断为ACTH分泌性垂体腺瘤所致皮质醇增多症患者的肿瘤样本。采用Affymetrix微阵列平台对12例促肾上腺皮质激素细胞腺瘤进行差异基因表达研究，根据改良Hardy标准将其分类为非侵袭性MIC（n=4）和MAC（n=5）以及侵袭性MAC（n=3）。同时研究了USP8的体细胞突变，但所有患者均未出现USP8变异。差异表达分析表明，非侵袭性MIC和MAC具有相似的遗传特征，而侵袭性MAC则表现出差异表达谱。在差异表达的基因中，我们重点关注了CCND2、ZNF676、DAPK1和TIMP2，并在另一组15例非侵袭性和3例侵袭性促肾上腺皮质激素细胞腺瘤中通过实时定量PCR验证了其差异表达。我们还鉴定了潜在的生物学

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。