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创建/更新时间

2026-11-05

资源简介

PRJNA207541: miR-106a-5p 通过靶向 FASTK 抑制星形细胞瘤细胞增殖和迁移并促进凋亡

该数据集围绕 miR-106a-5p 在星形细胞瘤细胞中的作用展开，核心目标是鉴定受 miR-106a-5p 直接或间接调控的全部转录本。研究通过 mRNA 微阵列实验，在 miR-106a-5p 水平升高或降低的条件下测量全局 mRNA 表达变化，并进一步结合生物信息学方法筛选候选靶基因，最终确认 FASTK 为 miR-106a-5p 的直接靶基因。数据集英文名称为 PRJNA207541: miR-106a-5p inhibits the proliferation and migration of astrocytoma cells and promotes apoptosis by targeting FASTK，本站分类为肿瘤 / 其他，来源站为 ebi.ac.uk。整体来看，该数据集提供了在肿瘤细胞中研究 miRNA 调控网络及靶基因验证的实验框架与表达数据基础。

【数据集背景】

该数据集的研究背景聚焦于星形细胞瘤中 miR-106a-5p 的功能及其调控机制。星形细胞瘤属于肿瘤领域的研究对象，而 miR-106a-5p 作为一种微小 RNA，其表达水平变化可能影响下游多个转录本的表达。为了系统识别受 miR-106a-5p 直接或间接调控的转录本，研究设计了 mRNA 微阵列实验，通过人为升高或降低 miR-106a-5p 水平，观察全局 mRNA 表达的变化。在此基础上，研究进一步锁定 FASTK 作为 miR-106a-5p 的直接靶基因，从而将 miRNA 调控与星形细胞瘤细胞的增殖、迁移和凋亡等行为联系起来。该数据集的标题也直接概括了核心结论：miR-106a-5p 通过靶向 FASTK 抑制星形细胞瘤细胞增殖和迁移，并促进凋亡。

【数据内容】

该数据集的主要内容是 mRNA 微阵列实验所产生的全局 mRNA 表达数据。实验条件包括在癌细胞中过表达或敲低 miR-106a-5p，以测量在 miR-106a-5p 水平升高或降低情况下的全局 mRNA 表达变化。这些表达数据用于鉴定受 miR-106a-5p 直接或间接调控的全部转录本。此外，数据集还涉及从差异调控基因中筛选候选 miR-106a-5p 靶基因的过程，并结合生物信息学程序来缩小候选靶基因的范围。最终，FASTK 被确定为 miR-106a-5p 的直接靶基因。除上述内容外，源站未提供更详细的数据文件列表、样本数量或具体表达矩阵信息。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ebi.ac.uk。根据源站描述，研究采用 mRNA 微阵列实验来测量全局 mRNA 表达。实验设计包括在癌细胞中过表达或敲低 miR-106a-5p，以观察转录本表达变化。随后，研究结合生物信息学程序从差异调控基因中选择候选 miR-106a-5p 靶基因，以精炼靶基因数量。在验证阶段，研究通过蛋白质印迹分析、定量实时 PCR 和荧光素酶报告基因实验来验证 miR-106a-5p 的靶基因。该数据集英文名称中包含了 PRJNA207541 这一标识，表明其来源于特定的公共数据库项目。除这些信息外，源站未提供关于样本采集地点、时间、细胞系具体名称或实验操作细节的更多内容。

【适用场景】

该数据集适用于研究 miRNA 调控网络、肿瘤分子机制以及靶基因验证的科研场景。具体而言，可用于分析 miR-106a-5p 在星形细胞瘤细胞中对全局 mRNA 表达的影响，识别受其直接或间接调控的转录本，并探索 FASTK 作为直接靶基因的功能意义。此外，该数据集也可用于方法学参考，例如如何结合 mRNA 微阵列、生物信息学筛选以及蛋白质印迹、定量实时 PCR 和荧光素酶报告基因实验来验证 miRNA 靶基因。对于关注肿瘤细胞增殖、迁移和凋亡机制的研究者，该数据集提供了与 miR-106a-5p 和 FASTK 相关的实验设计思路和表达数据基础。源站未提供该数据集在其他具体应用场景中的使用记录或推荐用途。

【使用方法】

该数据集的使用需基于 mRNA 微阵列实验所产生的全局 mRNA 表达数据。研究者可比较 miR-106a-5p 过表达与敲低条件下转录本表达的变化，从而筛选差异调控基因。随后，可结合生物信息学程序从这些差异基因中预测候选 miR-106a-5p 靶基因，并进一步通过蛋白质印迹分析、定量实时 PCR 和荧光素酶报告基因实验进行验证。该数据集的核心使用路径是：从全局表达变化出发，经过生物信息学筛选，最终确认直接靶基因 FASTK。由于源站未提供具体的数据格式、访问方式或分析流程细节，实际使用时需参考来源站 ebi.ac.uk 上的原始记录。源站未提供关于数据下载、预处理或统计方法的进一步说明。

【质量与限制】

该数据集基于 mRNA 微阵列实验和多种验证实验，包括蛋白质印迹分析、定量实时 PCR 和荧光素酶报告基因实验，这些方法共同支持了 FASTK 作为 miR-106a-5p 直接靶基因的结论。然而，源站未提供关于样本量、重复次数、数据标准化方法或统计显著性阈值的具体信息，因此无法对数据质量进行更细致的评估。此外，该数据集仅涉及 miR-106a-5p 在星形细胞瘤细胞中的研究，其结论是否适用于其他肿瘤类型或生理条件尚不明确。源站未提供关于数据完整性、批次效应或潜在技术偏差的说明。使用者在解释结果时应考虑这些限制，并结合自身研究背景进行判断。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ebi.ac.uk，英文名称为 PRJNA207541: miR-106a-5p inhibits the proliferation and migration of astrocytoma cells and promotes apoptosis by targeting FASTK。源站未提供具体的引用格式、许可协议或使用条款信息。如需引用或使用该数据集，建议直接访问来源站 ebi.ac.uk 查询相关项目的官方说明。源站未提供关于数据共享政策、版权归属或商业使用限制的进一步内容。

原始链接

https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA207541

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源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA207541

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

进行mRNA微阵列实验以测量在miR-106a-5p水平升高或降低时全局mRNA表达，从而鉴定由miR-106a-5p直接或间接调控的所有转录本。FASTK被确定为miR-106a-5p的直接靶基因。总体设计：为了鉴定由miR-106a-5p直接或间接调控的所有转录本，我们首先通过在癌细胞中过表达或敲低miR-106a-5p，利用mRNA微阵列测量全局mRNA表达变化。接下来，我们结合生物信息学程序从差异调控的基因中筛选候选miR-106a-5p靶标，以精简miR-106a-5p靶标的数量。然后，我们通过蛋白质印迹分析、定量实时PCR和荧光素酶报告基因实验验证了miR-106a-5p靶基因。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别