BRAF V600E突变在成釉细胞瘤和牙源性角化囊肿中的多中心横断面调查

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA1200226

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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数据说明

背景：BRAF V600E突变是一项关键的遗传学改变，与多种肿瘤密切相关，在其发病机制及潜在的靶向治疗策略中发挥重要作用。目的：本横断面研究旨在确定泰国多中心常见牙源性病变（包括成釉细胞瘤和牙源性角化囊肿（OKC））中BRAF V600E突变的频率。方法：对取自泰国中部、北部、南部和东北部四个主要牙科院校的227例传统型成釉细胞瘤（AM）、113例单囊型成釉细胞瘤（UA）和68例OKC组织样本进行抗BRAF V600E（克隆VE1）免疫组化染色。同时从随机选取的AM病例的FFPE切片中对肿瘤细胞进行显微切割，并进行DNA测序以验证免疫组化结果。结果：在71.8%的AM样本中检测到BRAF V600E突变，而65.5%的UA样本显示BRAF V600E阳性。四个中心AM组织学亚型之间（p = 0.012）以及三个中心UA发生部位之间（p = 0.013）的BRAF V600E突变存在显著差异。

在来自中央MU中心的AMs中，BRAF V600E突变与下颌骨部位之间存在统计学显著关联（p = 0.033），在来自南部PSU中心的AMs中，该突变与组织学亚型之间也存在统计学显著关联（p = 0.009）。然而， none of the OKC cases exhibited the BRAF V600E mutation。BRAF V600E突变与AM和UA复发之间分别未观察到统计学关联（p = 0.920和p = 0.312）。对随机选取的40例BRAF V600E阳性和20例BRAF V600E阴性成釉细胞瘤组织进行的DNA测序结果与免疫组化发现一致。结论：由于泰国成釉细胞瘤患者中BRAF V600E具有显著患病率，他们可能从辅助性抗BRAF靶向治疗的应用中获益。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。