膀胱癌患者外周血单个核细胞mRNA的RNA-seq分析
数据聚焦膀胱癌患者外周血单个核细胞的转录组层面，可用于研究膀胱癌相关的基因表达特征。本站将其归入肿瘤/其他分类，主题标签为 Other（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
膀胱癌患者外周血单个核细胞mRNA的RNA-seq分析
PRJEB61152 是一个聚焦于膀胱癌患者外周血单个核细胞（PBMCs）转录组层面的公开数据集，其英文全称为“mRNA analysis on peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) performed by RNA-seq in patients with Bladder Cancer”。该数据集通过 RNA-seq 技术对膀胱癌患者外周血单个核细胞中的 mRNA 进行分析，旨在从基因表达层面刻画膀胱癌相关的转录特征。数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库，本站将其归入“肿瘤 / 其他”分类，主题标签为 Other。整体而言，该数据集为研究膀胱癌患者外周血免疫细胞的基因表达变化提供了转录组学层面的数据基础，可供相关领域的科研人员参考和使用。
【数据集背景】
膀胱癌是泌尿系统常见的恶性肿瘤之一，其发生发展涉及复杂的分子机制。外周血单个核细胞包括淋巴细胞、单核细胞等免疫相关细胞，在肿瘤免疫应答和全身免疫状态中扮演重要角色。对该类细胞进行 mRNA 层面的 RNA-seq 分析，有助于从外周血角度探索膀胱癌患者的基因表达特征。该数据集以 BioProject 形式组织，BioProject 是围绕某一特定研究计划或倡议汇集生物数据的集合，通常来源于单一机构或联合体，并为用户提供统一入口以查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集正是围绕膀胱癌患者 PBMCs 的 mRNA 分析这一研究目标而建立。
【数据内容】
该数据集的核心内容是膀胱癌患者外周血单个核细胞的 mRNA 分析结果，采用 RNA-seq 技术获得。其数据聚焦于转录组层面，可用于研究膀胱癌相关的基因表达特征。数据集的主题标签为 Other，本站分类为“肿瘤 / 其他”。关于样本数量、测序深度、基因覆盖度、差异表达基因列表等具体数据指标，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“mRNA analysis on peripheral blood mononuclear cell... (ID 989917) - BioProject - NCBI”。其 BioProject 记录提供了查找该项目所生成各类数据的统一入口。关于样本采集的具体时间、地点、患者入组标准、伦理审批信息以及测序平台和试剂等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于膀胱癌相关的基础与转化研究，尤其是从外周血单个核细胞角度探索基因表达特征的研究方向。潜在应用包括：分析膀胱癌患者 PBMCs 中 mRNA 的表达模式，寻找与膀胱癌相关的候选基因或表达特征，为后续的生物标志物研究或免疫相关机制研究提供转录组层面的参考。此外，该数据集也可用于与其他膀胱癌转录组数据的比较分析或方法学验证。关于具体的分析流程、统计方法和验证结果，源站未提供。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问该数据集，利用其提供的链接查找该项目所生成的相关数据。由于 BioProject 记录本身是数据类型的汇集入口，使用者可根据项目页面指引进一步获取 RNA-seq 相关数据文件。关于数据下载的具体格式、预处理步骤、标准化方法以及推荐的分析工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject 数据库，属于公开可获取的生物数据资源。其数据聚焦于膀胱癌患者 PBMCs 的 mRNA 分析，主题标签为 Other。关于数据质量评估指标、样本量大小、批次效应、测序质量参数以及潜在的混杂因素等，源站未提供。使用者在使用时应结合自身研究目的，对数据的适用性和局限性进行独立判断。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库，源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的具体引用方式、许可协议、使用条款以及是否存在使用限制等信息，源站未提供。建议使用者在引用或使用前查阅 NCBI BioProject 页面上的相关说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB61152
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
膀胱癌（BC）是泌尿系统最常见的恶性肿瘤，在男性中排名第4位，在女性中排名第18位，主要分为非肌层浸润性和肌层浸润性。近期研究表明，转录组活性的变化可能促进癌变。因此，转录组研究可能有助于识别其他差异表达的癌症相关候选基因，从而更好地理解BC中基因调控的分子基础。本病例对照研究包括对来自公开数据集的11例BC患者（11名男性；平均年龄63.00±9.88岁）和19名年龄、性别匹配的健康对照者（19名男性；平均年龄58.81±23.41岁）通过RNA-seq进行的mRNA分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
