PRJEB103835:携带新型HRAS突变的成釉细胞瘤组织样本

来自一名携带HRAS c.22G>A(p.V8M)突变的越南患者的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)成釉细胞瘤组织,该突变经Sanger测序确认

ena
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基因组成釉细胞瘤HRAS突变FFPE组织Sanger测序肿瘤
PRJEB103835: Ameloblastoma tissue sample with a novel HRAS mutation

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

PRJEB103835:携带新型HRAS突变的成釉细胞瘤组织样本

PRJEB103835 收录的是一份成釉细胞瘤组织样本,来源于一名越南患者。该样本为福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织,携带 HRAS c.22G>A(p.V8M)突变,并已通过 Sanger 测序确认。成釉细胞瘤属于颌骨来源的牙源性上皮性肿瘤,HRAS 突变是此类肿瘤中已被报道的分子事件之一,该数据集围绕这一特定突变样本建立,可为研究者提供一份带有明确分子注释的肿瘤组织材料记录。数据集在站内归入肿瘤 / 其他类别,来源站点为 ebi.ac.uk。以下依据可获得的信息,对该数据集的相关方面作分项说明。

【数据集背景】

成釉细胞瘤是口腔颌面部较常见的牙源性肿瘤,其发生发展涉及多种基因变异。该数据集所对应的样本来自一名越南患者,其肿瘤组织携带 HRAS c.22G>A(p.V8M)突变。该突变位点与氨基酸改变已有明确对应关系,并经过 Sanger 测序这一经典的一代测序方法加以确认。数据集以该特定突变样本为核心,属于单样本层面的肿瘤组织记录,而非大规模队列。关于该样本所对应的具体研究项目背景、项目负责人、所属研究机构以及更完整的临床信息,源站未提供。

【数据内容】

该数据集的核心内容为一份成釉细胞瘤肿瘤组织样本,其材料形式为福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织。样本的关键分子特征为 HRAS c.22G>A(p.V8M)突变,该突变状态经 Sanger 测序确认。数据集名称中明确标注了“novel HRAS mutation”这一表述,指向该突变在该样本中的发现。关于数据集内具体包含的文件类型、数据格式、文件数量、测序原始数据是否公开、是否包含病理图像或临床随访数据等细节,源站未提供。

【采集与来源】

样本来源于一名越南患者的成釉细胞瘤组织,采集后以 FFPE 方式保存。FFPE 是病理组织常规保存方式,便于长期存档与后续分子检测。样本的突变确认采用 Sanger 测序完成。数据集通过 ebi.ac.uk 来源站发布,站内分类为肿瘤 / 其他。关于样本采集的具体时间、采集机构、患者年龄与性别、肿瘤部位与分期、伦理审批信息以及样本入库编号等,源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集可用于涉及成釉细胞瘤分子特征的研究场景,例如针对 HRAS c.22G>A(p.V8M)突变的验证性检测、FFPE 组织中低频突变检测方法的比对,以及以 Sanger 测序为参考方法评估其他测序平台表现的研究。由于样本带有明确的突变注释,也可作为成釉细胞瘤 HRAS 突变相关研究中的阳性对照材料参考。关于该数据集是否适用于特定类型的高通量测序分析、是否可用于药物敏感性研究或临床诊断用途,源站未提供,使用者应自行评估。

【使用方法】

该数据集以 FFPE 组织样本形式存在,使用时应遵循 FFPE 样本的常规处理流程,包括切片、核酸提取与质量控制等步骤。由于突变已通过 Sanger 测序确认,使用者可将 Sanger 测序作为验证手段,或以其为参照评估其他检测方法的结果。关于数据的具体下载方式、访问入口、文件组织结构和配套元数据字段,源站未提供,需以来源站点的实际发布信息为准。

【质量与限制】

该样本的突变状态经 Sanger 测序确认,具备方法学上的直接证据。但需注意,该数据集为单一样本记录,样本量有限,不宜直接用于群体层面的统计推断。FFPE 组织在固定与包埋过程中可能引起核酸降解或修饰,可能影响后续分子检测的灵敏度与准确性,使用时应进行质量评估。关于该样本的肿瘤细胞含量、组织学分级、测序覆盖度与重复性验证等质量指标,源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、文献出处、数据许可协议与使用限制,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集前,应查阅来源站点 ebi.ac.uk 上该条目的正式说明,并遵循相应的数据使用规范。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB103835

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) ameloblastoma tumor tissue from a Vietnamese patient carrying the HRAS c.22G>A (p.V8M) mutation, confirmed by Sanger sequencing

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