POG_patient_43716 样本数据集

该数据集来自 omicsdi.org,收录一例中枢神经系统非生殖细胞瘤性生殖细胞肿瘤患者的基因组与转录组测序数据,属于 BC Cancer Agency 的 Pediatric Personalized Onco-Genomics 研究项目

omicsdi
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基因组Genomics
POG_patient_43716 - samples

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-28

资源简介

POG_patient_43716 样本数据集

POG_patient_43716 - samples 是一个收录于 omicsdi.org 的肿瘤基因组学数据集,聚焦于中枢神经系统非生殖细胞瘤性生殖细胞肿瘤这一罕见病种。该数据集汇集了一例患者样本的基因组与转录组测序数据,来源于 BC Cancer Agency 开展的 Pediatric Personalized Onco-Genomics(儿童个体化肿瘤基因组学)研究项目。从分类上看,它归属于肿瘤领域的“其他”类别,主题标签为 Genomics。该数据集为研究儿童中枢神经系统生殖细胞肿瘤的分子特征提供了来自真实患者样本的序列数据资源,适合用于基因组与转录组层面的探索性分析。

【数据集背景】

该数据集所属的 Pediatric Personalized Onco-Genomics 研究由 BC Cancer Agency 发起,其目标在于通过对儿童肿瘤患者样本进行基因组与转录组测序,获取与个体化诊疗相关的分子信息。POG_patient_43716 - samples 正是这一项目框架下针对一例中枢神经系统非生殖细胞瘤性生殖细胞肿瘤患者所产生的样本级数据集合。中枢神经系统非生殖细胞瘤性生殖细胞肿瘤属于儿童神经系统肿瘤中的特殊类型,其分子层面的系统刻画相对有限,该数据集因此具备一定的罕见病种研究价值。

【数据内容】

依据源站描述,该数据集包含来自同一例患者的基因组与转录组序列数据。基因组层面与转录组层面的数据共同构成对该患者肿瘤样本的分子特征描述。数据集以样本(samples)为单位组织,英文名中的“samples”表明其内容围绕该患者的样本展开。数据的具体文件格式、样本数量、测序平台、覆盖深度、变异检出结果等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 omicsdi.org,原始产生方为 BC Cancer Agency 的 Pediatric Personalized Onco-Genomics 研究项目。数据对应的对象是一例中枢神经系统非生殖细胞瘤性生殖细胞肿瘤患者。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息、样本处理流程与测序实验条件,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于儿童中枢神经系统非生殖细胞瘤性生殖细胞肿瘤的基因组与转录组特征研究,例如作为此类罕见肿瘤分子图谱的补充数据,或用于与同类样本进行比较分析的方法学探索。鉴于其属于个体化肿瘤基因组学研究项目的一部分,也可为个体化肿瘤基因组学在儿童肿瘤中的应用研究提供实例数据。具体的分析用途需结合数据实际内容判断,源站未提供明确的推荐应用范围。

【使用方法】

该数据集以样本为单位组织,使用者可按样本获取对应的基因组与转录组序列数据并开展分析。关于数据下载方式、文件组织格式、配套分析流程或使用说明,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集仅涉及一例患者,样本量有限,不宜直接用于群体水平的统计推断。数据的具体质量指标、测序质量评估结果、数据完整性说明等,源站未提供。使用时应结合数据实际情况评估其适用性。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001015327

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

来自一名中枢神经系统非生殖细胞瘤性生殖细胞肿瘤患者基因组和转录组测序数据,这些数据是作为BC癌症机构儿科个性化肿瘤基因组学研究的一部分产生的

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