POG患者39432样本数据集

该数据集来自BC Cancer Agency的Personalized OncoGenomics(POG)研究,包含一名原发灶不明的转移性腺癌(疑似上消化道来源)患者的基因组与转录组测序数据

omicsdi
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基因组分类Genomics
POG_patient_39432 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

POG患者39432样本数据集

POG_patient_39432 - samples 数据集收录于 omicsdi.org,归类于肿瘤 / 其他方向,主题标签为 Genomics。该数据集源自 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究,包含一名原发灶不明的转移性腺癌患者的基因组与转录组测序数据。根据源站描述,该患者的原发灶来源尚不明确,临床线索提示可能为上消化道来源。数据集以样本为单位组织,围绕该患者的肿瘤基因组与转录组信息展开,可用于了解 POG 研究中针对原发灶不明转移性腺癌所生成的多组学数据形态与内容构成。

【数据集背景】

该数据集属于 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究的一部分。POG 研究关注个体化肿瘤基因组学,通过对患者肿瘤样本进行基因组与转录组测序,获取与肿瘤相关的分子信息。本数据集对应的患者被诊断为原发灶不明的转移性腺癌,源站描述中特别标注了“upper GI?”这一线索,提示临床层面怀疑其原发部位可能位于上消化道,但并未给出明确结论。数据集名称中的“POG_patient_39432”指向该研究中的特定患者编号,“samples”则表明数据以样本为组织单位。

【数据内容】

该数据集包含来自同一名患者的基因组与转录组测序数据。基因组层面涉及肿瘤的 DNA 序列信息,转录组层面涉及 RNA 表达相关信息。源站描述仅说明数据为“Genome and transcriptome sequence data”,未进一步列出具体测序平台、读长、覆盖深度、样本数量、文件格式或数据体积等细节。数据集的主题标签为 Genomics,本站分类为肿瘤 / 其他,说明其内容与肿瘤基因组学相关,且未被归入更细分的肿瘤类型类别。

【采集与来源】

数据来源于 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究,由该机构生成。来源站为 omicsdi.org。源站描述未提供样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息、患者人口学特征或临床治疗背景等细节。数据集名称中的患者编号 39432 为该研究内部的标识,用于区分不同患者的样本与数据。

【适用场景】

该数据集可用于肿瘤基因组学与转录组学相关的研究场景,尤其是针对原发灶不明转移性腺癌的分子特征探索。由于数据同时包含基因组与转录组信息,潜在用途包括分析肿瘤的基因变异与表达特征、辅助判断可能的组织来源或分子分型,以及作为 POG 研究中同类病例的参考数据。此外,该数据集也可用于方法学层面的测试,例如肿瘤多组学数据的整合分析流程验证。需要说明的是,以上适用方向基于数据集的主题与内容类型,源站未针对具体用途给出明确说明。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法、下载方式、文件组织格式或配套分析工具。使用者需依据 omicsdi.org 来源站及 BC Cancer Agency 的 POG 研究相关数据访问政策自行获取与处理数据。由于源站未说明数据是否经过标准化处理、是否附带临床注释或是否提供原始测序文件,使用前应核实数据文件的完整性与可用性。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量评估信息,包括测序质量指标、数据完整性、批次效应或验证情况等。该数据集仅涉及单名患者,样本量有限,不适合直接用于群体层面的统计推断。患者原发灶不明且临床线索仅提示可能为上消化道来源,这一不确定性会影响基于该数据得出的组织来源相关结论。此外,源站描述未说明数据是否包含正常对照样本,也未说明肿瘤纯度或异质性情况,这些因素均可能影响分析结果的解释。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式、许可协议或使用条款。使用者应参考 omicsdi.org 来源站及 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究的相关政策,确认数据使用与发表时的引用要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001005837

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

来自一名转移性未知原发灶(上消化道?)腺癌患者的基因组和转录组测序数据,作为BC癌症机构个性化肿瘤基因组学(POG)研究的一部分生成。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

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