POG患者39281样本数据集

该数据集来源于BC Cancer Agency的Personalized OncoGenomics(POG)研究,包含一名转移性食管鳞状细胞癌患者的基因组与转录组测序样本数据

omicsdi
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基因组Genomics
POG_patient_39281 - samples

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-28

资源简介

POG患者39281样本数据集

POG_patient_39281 - samples 是一个聚焦于肿瘤领域的基因组学数据集,收录于 omicsdi.org 来源站,归类为肿瘤 / 其他。该数据集来源于 BC Cancer Agency 开展的 Personalized OncoGenomics(POG)研究,包含一名转移性食管鳞状细胞癌患者的基因组与转录组测序样本数据。作为 POG 研究框架下的个体化肿瘤基因组数据实例,它为研究者提供了从真实患者样本中获取的基因组与转录组序列信息,主题标签为 Genomics,可用于围绕食管鳞状细胞癌转移病例的分子特征开展探索性分析。

【数据集背景】

该数据集隶属于 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究。POG 研究以个体化肿瘤基因组学为核心方向,通过对患者肿瘤样本进行基因组与转录组测序,形成与具体患者关联的序列数据。本数据集即为该研究产出的一个患者级数据实例,对应一名转移性食管鳞状细胞癌患者。数据集的英文名称为 POG_patient_39281 - samples,其中患者编号与样本标识共同构成其在 POG 研究体系中的定位。在 omicsdi.org 来源站上,该数据集被归入肿瘤 / 其他分类,并以 Genomics 作为主题标签,体现出其以测序数据为主体的组学属性。

【数据内容】

按照源站描述,该数据集包含来自一名转移性食管鳞状细胞癌患者的基因组与转录组序列数据。也就是说,数据内容覆盖两个层面:一是基因组层面的序列信息,二是转录组层面的序列信息,二者均来自同一患者的肿瘤样本。数据集名称中的“samples”表明其组织形态为样本级数据集合,而非单一序列文件。除上述基因组与转录组序列数据的范围描述外,源站未提供关于样本数量、测序平台、读长、覆盖度、文件格式及数据体积等更细化的内容。

【采集与来源】

该数据由 BC Cancer Agency 在 Personalized OncoGenomics(POG)研究过程中产生,来源站为 omicsdi.org。源站描述明确指出,这些序列数据是作为 POG 研究的一部分而生成的,采集对象为一名转移性食管鳞状细胞癌患者。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息、样本处理流程及测序服务提供方等细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其内容构成,该数据集适用于与食管鳞状细胞癌转移病例相关的基因组学与转录组学探索,例如在个体化肿瘤基因组研究背景下考察该患者样本的序列数据特征。主题标签 Genomics 也提示其可服务于以基因组序列为核心的分析场景。需要说明的是,上述适用方向系依据数据内容范围所作的通用性说明,源站未提供该数据集的具体应用案例、分析结论或验证结果。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据获取方式、访问地址、文件组织说明、预处理步骤及分析工具建议等。使用者如需使用,应以 omicsdi.org 来源站及 BC Cancer Agency POG 研究的相关说明为准。

【质量与限制】

源站未提供关于该数据集质量评估、数据完整性、测序质量指标及已知偏差等信息。就已知范围而言,该数据集为单一患者来源的样本级数据,其覆盖范围限于一名转移性食管鳞状细胞癌患者的基因组与转录组序列,不宜直接外推为群体层面的结论。其他限制性信息源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式、许可条款及使用限制等信息。使用者在引用或再利用该数据前,应自行核实来源站与 BC Cancer Agency POG 研究发布的相关政策。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001005835

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

来自一名转移性食管鳞状细胞癌患者的基因组和转录组序列数据,作为BC癌症机构个性化肿瘤基因组学(POG)研究的一部分生成。

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