POG 结肠癌患者 37826 样本数据集

该数据集来自 omicsdi.org,收录一名结肠癌患者的基因组与转录组测序数据,属于 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究项目的一部分

omicsdi
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基因组Genomics
POG_patient_37826 - samples

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

POG 结肠癌患者 37826 样本数据集

POG_patient_37826 - samples 是一个聚焦于结肠癌的肿瘤基因组学数据集,来源于 omicsdi.org,收录了一名结肠癌患者的基因组与转录组测序数据。该数据产生于 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究项目,主题标签为 Genomics,在本站归入肿瘤 / 其他分类。数据集以单名患者的样本为核心,体现了 POG 研究以个体患者为单元、整合多组学信息开展个性化肿瘤分析的基本组织方式。对于关注结肠癌分子特征、个体化肿瘤基因组学研究以及多组学数据整合应用的研究者而言,该数据集提供了一个具体患者层面的数据实例,可用于了解此类研究数据的构成与来源背景。

【数据集背景】

该数据集属于 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究项目。POG 研究以患者个体为单位,对其肿瘤样本开展基因组与转录组层面的测序分析,目的是在个体化医疗框架下获取肿瘤的分子层面信息。POG_patient_37826 - samples 正是这一研究体系中的单名患者数据条目,其命名中的患者编号标识了它在 POG 研究中的个体归属。数据集通过 omicsdi.org 对外发布与索引,主题标签为 Genomics,本站将其归入肿瘤 / 其他分类。

【数据内容】

数据集包含一名结肠癌患者的基因组与转录组序列数据。基因组数据对应肿瘤样本的 DNA 层面测序信息,转录组数据对应 RNA 层面的表达相关信息,两者共同构成对该患者肿瘤的分子层面刻画。数据以样本(samples)为单位组织,条目名称中的“samples”表明其内容围绕该患者的样本展开。除上述基因组与转录组序列数据外,数据集是否包含临床注释、变异注释、表达定量结果或其它衍生文件,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究,由该机构在结肠癌患者诊疗与研究过程中产生。数据集通过 omicsdi.org 这一组学数据索引平台发布,本站收录的信息即来自该来源站。关于样本采集的具体时间、地点、样本类型(如原发灶或转移灶)、测序平台、测序策略与测序深度等实验细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于结肠癌分子特征相关的探索性工作,例如在个体患者层面考察基因组变异与转录组表达之间的关系,或作为多组学整合分析方法的示例数据。由于数据来自 POG 这一以个体化肿瘤基因组学为目标的研究项目,它也可用于了解该类研究的数据组织方式,以及单患者多组学数据在个性化肿瘤分析中的呈现形式。此外,该数据集可作为组学数据索引与共享平台使用场景下的检索与引用实例。需要强调的是,单名患者的数据规模有限,不适合直接用于群体水平的统计推断或泛化性结论的验证。

【使用方法】

使用者可通过 omicsdi.org 检索数据集名称 POG_patient_37826 - samples 定位该条目,并依据源站提供的访问途径获取数据。使用前应确认数据的具体文件组成与格式,以便区分基因组与转录组数据并安排相应的分析流程。由于数据集以单名患者的样本为单位,分析设计宜围绕个体层面的分子特征描述展开。关于数据下载的具体权限要求、文件格式说明与配套分析工具,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集仅涉及一名结肠癌患者,样本量与患者数量均有限,因此其结果不具备群体代表性,不能直接外推至其他结肠癌患者或更广泛的肿瘤人群。数据仅覆盖基因组与转录组两个层面,是否包含其它组学层面或临床随访信息,源站未提供。关于测序质量指标、数据完整性、是否存在批次效应以及数据更新维护情况,源站未提供。使用者在开展分析时应充分考虑单样本数据在统计效力上的局限。

【引用与许可】

该数据集来自 omicsdi.org,原始研究归属 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)项目。关于数据的具体许可协议、使用条款、引用格式以及是否允许再分发或商业使用,源站未提供,使用者在获取与使用数据前应向来源站核实相关要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001005826

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

来自一名结肠癌患者的基因组和转录组序列数据,这些数据是作为BC癌症机构个性化肿瘤基因组学(POG)研究的一部分生成的

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