POG_patient_37094 样本数据集

该数据集来自BC Cancer Agency的Personalized OncoGenomics(POG)研究,包含一例C1-C2脊柱低分化脊索瘤患者的基因组与转录组测序数据

omicsdi
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基因组Genomics
POG_patient_37094 - samples

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

POG_patient_37094 样本数据集

POG_patient_37094 - samples 是一个公开的肿瘤基因组学数据集,来源于 omicsdi.org,在本站被归类为肿瘤 / 其他类别。该数据集围绕一例发生于 C1-C2 脊柱的低分化脊索瘤患者展开,收录了由 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究产生的基因组与转录组测序数据。其主题标签为 Genomics,整体定位属于精准肿瘤学研究中针对罕见或特殊部位肿瘤的个体化测序数据资源。对于关注脊索瘤分子特征、脊柱肿瘤基因组变异以及个体化肿瘤研究的数据使用者而言,该数据集提供了一个以单例患者为单位的测序样本集合,可用于探索该病例在基因组和转录组层面的信息。

【数据集背景】

该数据集来自 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究。POG 研究以个体化肿瘤基因组学为核心方向,通过对患者肿瘤样本进行基因组和转录组测序,获取与肿瘤相关的分子信息。本数据集所对应的病例是一例 C1-C2 脊柱低分化脊索瘤患者。脊索瘤本身属于相对少见的肿瘤类型,而低分化脊索瘤在临床和分子层面更具特殊性,发生于 C1-C2 脊柱部位则进一步增加了该病例的独特性。因此,该数据集作为 POG 研究的一部分,承载了针对这一特定患者肿瘤的测序数据,可用于围绕该病例开展基因组与转录组层面的分析和研究。

【数据内容】

该数据集包含来自一例 C1-C2 脊柱低分化脊索瘤患者的基因组与转录组序列数据。从名称中的“samples”可以看出,该数据集以样本为单位组织数据,对应患者来源的测序样本。其主题标签为 Genomics,表明数据内容主要围绕基因组学信息展开。基因组和转录组两类数据的结合,使得该数据集能够同时反映肿瘤在 DNA 和 RNA 层面的特征。除上述信息外,关于具体样本数量、测序平台、测序深度、数据文件格式、变异注释结果等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 omicsdi.org。根据源站描述,数据由 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究产生,研究对象为一例 C1-C2 脊柱低分化脊索瘤患者。数据集的英文名称为 POG_patient_37094 - samples,其中患者编号信息体现在名称之中。该数据集在本站被归类为肿瘤 / 其他,主题标签为 Genomics。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息、样本处理流程以及测序中心等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤基因组学与转录组学相关的研究场景,尤其是针对脊索瘤这一肿瘤类型的探索性分析。由于数据来自一例 C1-C2 脊柱低分化脊索瘤患者,可用于单病例层面的基因组变异和转录组表达特征研究,也可作为罕见肿瘤分子特征比较分析中的个体样本资源。此外,该数据集还可用于与 POG 研究相关的个体化肿瘤基因组学方法学讨论,或作为肿瘤精准医学研究中单患者测序数据的示例。关于该数据集是否适用于特定分析流程、是否可用于临床决策支持或是否经过特定验证,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过来源站 omicsdi.org 获取。使用者可根据数据集名称 POG_patient_37094 - samples 在来源站进行检索和访问。由于数据包含基因组与转录组序列信息,通常需要具备一定的生物信息学分析能力,使用相应的序列分析工具进行处理。关于具体的下载方式、数据访问权限、是否需要注册或申请、推荐的分析流程以及配套元数据文件等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于 BC Cancer Agency 的 POG 研究产生,来源站为 omicsdi.org。其核心限制在于数据仅对应一例 C1-C2 脊柱低分化脊索瘤患者,属于单病例样本集合,因此不适合直接用于群体层面的统计推断或泛化结论。此外,关于数据质量评估指标、测序覆盖度、数据完整性、是否存在批次效应以及样本重复情况等,源站未提供。使用者在使用时应充分注意单病例数据的局限性,并结合自身研究目的谨慎解读。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 omicsdi.org,原始研究背景为 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究。关于该数据集的具体引用方式、许可协议、使用条款、是否允许再分发以及商业使用限制等信息,源站未提供。使用者在引用或使用该数据集前,应自行查阅来源站及相关研究方的正式说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001008012

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

来自C1-C2脊柱患者的低分化脊索瘤的基因组和转录组序列数据,作为BC癌症机构个性化肿瘤基因组学(POG)研究的一部分生成。

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