POG_patient_36750 样本数据集

该数据集来自 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究,包含一名转移性食管腺癌患者的基因组与转录组测序样本数据

omicsdi
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基因组Genomics
POG_patient_36750 - samples

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-28

资源简介

POG_patient_36750 样本数据集

POG_patient_36750 - samples 是一个聚焦于肿瘤领域的基因组学数据集,来源于 omicsdi.org,其原始描述指向 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究。该数据集收录了一名转移性食管腺癌患者的基因组与转录组测序样本数据,属于 POG 研究中针对个体患者的多组学数据组成部分。从主题上看,该数据集以 Genomics 为核心标签,服务于对食管腺癌在基因组和转录组层面的深入观察。整体而言,这是一个以单名患者为单位的肿瘤多组学样本数据集,适合用于探索转移性食管腺癌的分子特征,并可作为 POG 研究框架下个体化肿瘤基因组学实践的一个具体数据实例。

【数据集背景】

该数据集隶属于 BC Cancer Agency 开展的 Personalized OncoGenomics(POG)研究。POG 研究以个体化肿瘤基因组学为核心方向,通过对患者肿瘤样本进行基因组与转录组测序,获取与患者肿瘤相关的分子数据。POG_patient_36750 - samples 正是这一研究体系下的一个患者级数据条目,对应一名转移性食管腺癌患者。数据集的命名中包含患者编号 36750,表明其以患者为单位组织样本数据,便于在个体层面关联基因组与转录组信息。该数据集在分类上归入肿瘤 / 其他类别,主题标签为 Genomics,体现了其在肿瘤基因组学数据资源中的定位。

【数据内容】

该数据集包含来自一名转移性食管腺癌患者的基因组与转录组测序样本数据。具体而言,数据覆盖两个层面的测序信息:一是基因组序列数据,二是转录组序列数据。这些数据以样本为单位组织,数据集名称中的“samples”提示其内容为样本级数据集合。数据所对应的疾病背景为转移性食管腺癌,即食管腺癌在转移状态下的肿瘤样本。除上述基因组与转录组测序样本这一核心内容外,关于样本数量、测序平台、数据文件格式、数据规模等更细化的信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 omicsdi.org,原始描述表明其数据由 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究产生。数据采集的对象为一名转移性食管腺癌患者,采集内容为该患者的基因组与转录组测序数据。关于样本采集的具体时间、采集部位、伦理审批信息、测序机构与具体流程等细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其内容构成,该数据集可用于转移性食管腺癌的基因组与转录组层面的研究场景,例如在个体患者水平上考察肿瘤的基因组变异特征与转录组表达特征。作为 POG 研究中的患者级样本数据,它也可用于个体化肿瘤基因组学相关方法与实践的参考,或作为肿瘤多组学数据整合分析的组成单元。此外,该数据集可服务于以 Genomics 为主题的分析场景,支持对食管腺癌分子数据的探索性使用。关于具体的分析用途、验证结论或临床应用方向,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以样本为单位组织,包含基因组与转录组测序数据,使用时可按照患者编号 36750 对应的样本进行数据检索与获取。关于数据下载方式、文件组织目录、数据格式说明、配套分析流程或使用教程等具体操作信息,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为单名患者的样本级数据,其覆盖范围限于该转移性食管腺癌患者的基因组与转录组测序内容,不包含其他患者或更广泛队列的数据。关于数据质量评估指标、测序深度、数据完整性、批次信息以及使用中的注意事项,源站未提供。使用者在依赖该数据集开展分析时,应注意到其个体化、单患者的数据属性所带来的适用范围限制。

【引用与许可】

该数据集来源于 omicsdi.org,原始数据由 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究产生。关于数据集的引用方式、许可协议、使用条款与再分发规定,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001004668

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

来自一名食管转移性腺癌患者的基因组和转录组测序数据,作为BC癌症机构个性化肿瘤基因组学(POG)研究的一部分生成。

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