POG_patient_25604 样本数据集

该数据集来自 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究,包含一名睾丸癌患者的基因组与转录组测序样本数据

omicsdi
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基因组Genomics
POG_patient_25604 - samples

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-30

资源简介

POG_patient_25604 样本数据集

POG_patient_25604 - samples 是一个聚焦于睾丸癌的基因组与转录组测序样本数据集,来源于 BC Cancer Agency 开展的 Personalized OncoGenomics(POG)研究。该数据集围绕一名睾丸癌患者,提供其基因组与转录组层面的序列数据样本,属于肿瘤领域下的“其他”类别,主题标签为 Genomics。从整体定位看,它属于个体化肿瘤基因组学研究中的患者级数据资源,可用于观察单一患者肿瘤在基因组与转录组两个层面的序列信息。该数据集在 omicsdi.org 上发布,英文名称为 POG_patient_25604 - samples,其核心价值在于将个体化肿瘤研究中的患者样本数据以可检索、可引用的形式呈现,为肿瘤基因组学相关的研究与教学提供具体的数据实例。

【数据集背景】

该数据集来自 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究。POG 研究以个体化肿瘤基因组学为核心方向,通过对患者肿瘤样本进行基因组与转录组测序,形成患者层面的序列数据。POG_patient_25604 - samples 正是这一研究框架下的一个患者级数据条目,对应一名睾丸癌患者。数据集的分类归属为肿瘤 / 其他,主题标签为 Genomics,说明其内容重心在于基因组学层面的测序信息,而非某一特定肿瘤亚型的专项数据库。源站描述明确指出,该数据是作为 POG 研究的一部分产生的,因此其背景与 POG 研究的整体目标一致,即围绕个体患者的肿瘤样本开展基因组与转录组序列分析。

【数据内容】

该数据集包含一名睾丸癌患者的基因组与转录组测序样本数据。从数据类型上看,涉及两个层面:一是基因组序列数据,二是转录组序列数据。数据集名称中的“samples”表明其组织方式以样本为单位,即围绕该患者的测序样本进行组织。主题标签为 Genomics,进一步提示基因组学信息是该数据集的核心内容。除上述范围外,关于样本的具体数量、测序平台、覆盖深度、文件格式、数据规模等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究,发布站点为 omicsdi.org。源站描述说明,这些序列数据是从一名睾丸癌患者生成,并作为 POG 研究的一部分。关于样本采集的具体时间、地点、临床背景、伦理审批信息以及测序实验的具体流程,源站未提供。

【适用场景】

基于其内容构成,该数据集适用于与肿瘤基因组学和转录组学相关的研究场景,例如作为个体化肿瘤基因组研究中的患者级数据实例,用于了解单一睾丸癌患者的基因组与转录组序列数据组织方式;也可用于基因组学教学、数据管理流程演示以及多组学数据整合方法的示例性练习。由于数据集仅涉及一名患者,其适用范围应理解为个体层面的示例性数据,而非群体统计或队列研究。关于该数据集是否已被用于特定发表研究或特定分析流程,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以样本为单位组织,使用者可按样本获取基因组与转录组序列数据。关于具体的下载方式、访问链接、文件目录结构、数据格式说明以及是否需要注册或申请权限,源站未提供。建议使用者在使用前先确认源站的数据访问条款与技术文档。

【质量与限制】

该数据集为单名患者的样本数据,样本规模有限,不适合直接用于群体层面的统计推断。关于数据质量评估指标、测序质量参数、缺失值情况、数据完整性校验信息以及版本更新记录,源站未提供。使用者应结合源站说明自行评估数据适用性。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制以及再分发条件,源站未提供。使用者在引用或使用该数据集前,应查阅源站的相关说明并遵循其要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001002632

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

来自一名睾丸癌患者的基因组和转录组序列数据,这些数据是作为BC癌症机构个性化肿瘤基因组学(POG)研究的一部分生成的

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

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