POG_patient_25604 样本数据集
该数据集来自 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究,包含一名睾丸癌患者的基因组与转录组测序样本数据

基本信息
资源简介
POG_patient_25604 样本数据集
POG_patient_25604 - samples 是一个聚焦于睾丸癌的基因组与转录组测序样本数据集,来源于 BC Cancer Agency 开展的 Personalized OncoGenomics(POG)研究。该数据集围绕一名睾丸癌患者,提供其基因组与转录组层面的序列数据样本,属于肿瘤领域下的“其他”类别,主题标签为 Genomics。从整体定位看,它属于个体化肿瘤基因组学研究中的患者级数据资源,可用于观察单一患者肿瘤在基因组与转录组两个层面的序列信息。该数据集在 omicsdi.org 上发布,英文名称为 POG_patient_25604 - samples,其核心价值在于将个体化肿瘤研究中的患者样本数据以可检索、可引用的形式呈现,为肿瘤基因组学相关的研究与教学提供具体的数据实例。
【数据集背景】
该数据集来自 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究。POG 研究以个体化肿瘤基因组学为核心方向,通过对患者肿瘤样本进行基因组与转录组测序,形成患者层面的序列数据。POG_patient_25604 - samples 正是这一研究框架下的一个患者级数据条目,对应一名睾丸癌患者。数据集的分类归属为肿瘤 / 其他,主题标签为 Genomics,说明其内容重心在于基因组学层面的测序信息,而非某一特定肿瘤亚型的专项数据库。源站描述明确指出,该数据是作为 POG 研究的一部分产生的,因此其背景与 POG 研究的整体目标一致,即围绕个体患者的肿瘤样本开展基因组与转录组序列分析。
【数据内容】
该数据集包含一名睾丸癌患者的基因组与转录组测序样本数据。从数据类型上看,涉及两个层面:一是基因组序列数据,二是转录组序列数据。数据集名称中的“samples”表明其组织方式以样本为单位,即围绕该患者的测序样本进行组织。主题标签为 Genomics,进一步提示基因组学信息是该数据集的核心内容。除上述范围外,关于样本的具体数量、测序平台、覆盖深度、文件格式、数据规模等细节,源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究,发布站点为 omicsdi.org。源站描述说明,这些序列数据是从一名睾丸癌患者生成,并作为 POG 研究的一部分。关于样本采集的具体时间、地点、临床背景、伦理审批信息以及测序实验的具体流程,源站未提供。
【适用场景】
基于其内容构成,该数据集适用于与肿瘤基因组学和转录组学相关的研究场景,例如作为个体化肿瘤基因组研究中的患者级数据实例,用于了解单一睾丸癌患者的基因组与转录组序列数据组织方式;也可用于基因组学教学、数据管理流程演示以及多组学数据整合方法的示例性练习。由于数据集仅涉及一名患者,其适用范围应理解为个体层面的示例性数据,而非群体统计或队列研究。关于该数据集是否已被用于特定发表研究或特定分析流程,源站未提供。
【使用方法】
该数据集以样本为单位组织,使用者可按样本获取基因组与转录组序列数据。关于具体的下载方式、访问链接、文件目录结构、数据格式说明以及是否需要注册或申请权限,源站未提供。建议使用者在使用前先确认源站的数据访问条款与技术文档。
【质量与限制】
该数据集为单名患者的样本数据,样本规模有限,不适合直接用于群体层面的统计推断。关于数据质量评估指标、测序质量参数、缺失值情况、数据完整性校验信息以及版本更新记录,源站未提供。使用者应结合源站说明自行评估数据适用性。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制以及再分发条件,源站未提供。使用者在引用或使用该数据集前,应查阅源站的相关说明并遵循其要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001002632
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
来自一名睾丸癌患者的基因组和转录组序列数据,这些数据是作为BC癌症机构个性化肿瘤基因组学(POG)研究的一部分生成的
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




