POG 患者 25572 样本数据集
数据覆盖该患者的基因组和转录组序列信息,可用于肿瘤基因组学研究,例如分析 Ewing 肉瘤的基因变异与表达特征,支持个性化肿瘤学相关的探索性分析(来源 omicsdi.org)

基本信息
资源简介
POG 患者 25572 样本数据集
POG_patient_25572 - samples 是一个来源于 omicsdi.org 的肿瘤基因组学数据集,收录于本站“肿瘤 / 其他”分类之下,主题标签为 Genomics。该数据集围绕一名 Ewing 肉瘤患者展开,包含其基因组与转录组序列数据,这些数据产生于 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究项目。从数据构成来看,它同时覆盖基因组和转录组两个层面的序列信息,因而具备从基因变异与基因表达两个角度刻画该患者肿瘤特征的基础条件。该数据集可用于肿瘤基因组学研究,例如分析 Ewing 肉瘤的基因变异与表达特征,并支持个性化肿瘤学相关的探索性分析。整体而言,这是一个以单名患者为对象、以多组学序列数据为内容、服务于肿瘤研究与个性化肿瘤学探索的数据资源。
【数据集背景】
该数据集来自 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究。POG 是一项以个性化肿瘤学为导向的研究计划,其思路是通过对患者肿瘤样本进行基因组和转录组测序,获取与肿瘤相关的分子层面信息,从而为肿瘤研究和个体化分析提供数据基础。本数据集即为该计划中一名 Ewing 肉瘤患者所产生的样本数据集合。Ewing 肉瘤是一种肿瘤类型,本数据集以该患者的肿瘤样本为对象,属于肿瘤基因组学研究中单患者层面的数据资源,其英文名称为 POG_patient_25572 - samples,在来源站 omicsdi.org 上以该名称标识。
【数据内容】
该数据集的内容为来自一名 Ewing 肉瘤患者的基因组和转录组序列数据。基因组序列数据对应患者肿瘤的 DNA 层面信息,转录组序列数据对应 RNA 层面信息,二者共同构成对该患者肿瘤的分子刻画。数据集的主题标签为 Genomics,本站分类归入“肿瘤 / 其他”。除上述基因组与转录组序列信息外,关于样本数量、测序平台、测序深度、文件格式、数据规模等具体技术细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org,其原始产生背景为 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究。数据采集对象为一名 Ewing 肉瘤患者,采集内容为该患者的基因组和转录组序列信息。关于具体的样本采集流程、伦理审批信息、样本处理与测序实验方案等,源站未提供。
【适用场景】
依据其数据构成,该数据集适用于肿瘤基因组学研究,尤其是围绕 Ewing 肉瘤的基因变异分析与基因表达特征分析。由于同时包含基因组与转录组序列数据,研究者可在变异层面与表达层面分别或联合开展探索。此外,该数据集支持个性化肿瘤学相关的探索性分析,可作为单患者多组学研究的案例数据使用。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性,源站未提供。
【使用方法】
该数据集以样本数据集合的形式提供,使用者可依据其基因组与转录组序列信息开展相应的分析工作。关于数据的具体下载方式、访问入口、文件组织方式、预处理流程以及推荐的分析工具与参数,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为单名 Ewing 肉瘤患者的数据,其样本范围限于该患者,因此不构成群体层面的代表性数据。关于数据质量评估指标、测序质量参数、数据完整性说明以及已知的技术限制,源站未提供。使用者在开展分析时应结合数据自身特点谨慎解读结果。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、文献出处、许可协议与使用条款,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001002625
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
来自一名尤文肉瘤患者的基因组和转录组序列数据,作为BC癌症机构个性化肿瘤基因组学(POG)研究的一部分生成。
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