POG患者25438样本数据集

该数据集来自BC Cancer Agency的Personalized OncoGenomics(POG)研究,包含一名食管腺癌患者的基因组与转录组测序数据

omicsdi
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基因组Genomics
POG_patient_25438 - samples

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-28

资源简介

POG患者25438样本数据集

POG_patient_25438 - samples 是一个来源于 omicsdi.org 的肿瘤类数据集,归类于“肿瘤 / 其他”。该数据集围绕一名食管腺癌患者展开,包含由 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究生成的基因组与转录组测序数据。POG 研究以个体化肿瘤基因组学为核心方向,通过对患者肿瘤样本进行基因组和转录组层面的测序分析,为理解肿瘤的分子特征提供数据基础。该数据集以 Genomics 为主题标签,样本数据构成其核心内容,适合作为肿瘤基因组学与转录组学研究的参考数据资源。以下从数据集背景、数据内容、采集与来源、适用场景、使用方法、质量与限制、引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

该数据集来自 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究。POG 研究是一项以个体化肿瘤基因组学为目标的研究计划,其基本思路是对癌症患者的肿瘤样本进行基因组与转录组测序,从而获取与患者肿瘤相关的分子层面数据。POG_patient_25438 - samples 正是该研究框架下针对一名食管腺癌患者所产生的样本数据集合。食管腺癌是消化系统肿瘤的一种,围绕该病种产生的基因组与转录组序列数据,为在个体化研究背景下考察该患者肿瘤的分子特征提供了原始素材。数据集在 omicsdi.org 上发布,并被归入肿瘤 / 其他类别,主题标签为 Genomics,体现了其在肿瘤基因组学研究中的定位。

【数据内容】

该数据集的核心内容是来自一名食管腺癌患者的基因组与转录组序列数据。基因组序列数据与转录组序列数据分别对应 DNA 层面和 RNA 层面的测序信息,二者结合可以支撑对肿瘤样本在遗传变异与基因表达两个维度上的观察。数据集名称中的“samples”表明其组织形态为样本层面的数据集合,即围绕该患者样本产生的测序数据。除上述内容外,关于样本数量、测序平台、数据文件格式、数据规模等具体细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 omicsdi.org。数据由 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究生成,研究对象为一名食管腺癌患者。源站描述明确指出,这些数据是该 POG 研究项目的一部分。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息以及测序实验的具体流程,源站未提供。

【适用场景】

基于其内容构成,该数据集可应用于肿瘤基因组学与转录组学相关的研究场景。例如,可用于考察食管腺癌样本在基因组序列层面的特征,或结合转录组序列数据观察基因表达层面的信息;也可作为个体化肿瘤基因组学研究中的样本级数据参考。由于数据来源于 POG 研究这一个体化肿瘤基因组学项目,其在方法学与研究方向上也与个体化肿瘤分析相关。关于该数据集在其他具体应用场景中的适用性,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以样本数据集合的形式提供,使用者可通过 omicsdi.org 获取相关数据。关于数据的具体下载方式、文件组织方式、数据处理与分析流程、配套工具或文档说明,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集仅涉及一名食管腺癌患者,属于单患者样本层面的数据集合,其覆盖范围有限。关于数据质量评估指标、测序深度、数据完整性、批次效应以及使用中的其他技术限制,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 omicsdi.org,原始数据由 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究生成。关于数据的具体引用方式、许可协议及使用条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001002612

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

来自一名食管腺癌患者、作为BC癌症机构个性化肿瘤基因组学(POG)研究一部分生成的基因组和转录组序列数据

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