POG 患者 22244 样本数据集

数据以样本形式组织,主题标签为 Genomics,本站归类为肿瘤/其他。可用于探索该患者肿瘤的基因组变异与转录组表达特征,支撑个性化肿瘤基因组学相关分析(来源 omicsdi.org)

omicsdi
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基因组Genomics
POG_patient_22244 - samples

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-28

资源简介

POG 患者 22244 样本数据集

POG_patient_22244 - samples 是一个以样本形式组织的肿瘤基因组学数据集,来源于 omicsdi.org,主题标签为 Genomics,在分类上归入肿瘤 / 其他。该数据集收录的是一名尤文肉瘤(Ewing sarcoma)患者的基因组与转录组测序数据,产生于 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究项目。作为个性化肿瘤基因组学研究的组成部分,这批样本数据可用于探索该患者肿瘤的基因组变异与转录组表达特征,为理解尤文肉瘤的分子层面特征以及开展个性化肿瘤基因组学相关分析提供数据基础。

【数据集背景】

该数据集属于 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究。POG 研究以患者个体为单位开展基因组与转录组测序,旨在从分子层面刻画肿瘤特征。本数据集对应其中一名尤文肉瘤患者,是该研究框架下产生的患者级样本数据。尤文肉瘤是一种发生在骨与软组织的肿瘤,本数据集所承载的基因组与转录组信息,为在分子水平上考察这一患者肿瘤的特征提供了原始素材。数据集在主题上归入 Genomics,在站点分类中归入肿瘤 / 其他。

【数据内容】

数据集以样本(samples)形式组织,内容为来自该尤文肉瘤患者的基因组和转录组序列数据。基因组序列数据对应肿瘤 DNA 层面的信息,转录组序列数据对应 RNA 表达层面的信息,二者共同构成对该患者肿瘤在遗传变异与基因表达两个维度上的刻画。数据集的英文名称为 POG_patient_22244 - samples,其中患者编号标识了数据所属的个体,样本形式则表明数据按样本单元进行组织与呈现。除上述内容外,源站未提供更细的数据字段、文件格式或样本数量说明。

【采集与来源】

数据来源于 omicsdi.org,原始描述指出这批数据由 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究产生,取自一名尤文肉瘤患者。数据集的分类信息为肿瘤 / 其他,主题标签为 Genomics。关于具体的测序平台、样本处理流程、采集时间与临床背景等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于探索该患者肿瘤的基因组变异与转录组表达特征,支撑个性化肿瘤基因组学相关分析。具体而言,基因组序列数据可用于考察肿瘤 DNA 层面的变异情况,转录组序列数据可用于考察基因表达层面的特征,两者结合有助于从分子层面描述该患者尤文肉瘤的基因组与转录组面貌。该数据也可作为个性化肿瘤基因组学研究中的患者级案例数据,用于相关分析方法的应用与验证。需要说明的是,以上场景均围绕该单一患者样本展开,不涉及群体层面的统计推断。

【使用方法】

数据集以样本形式组织,使用时应以样本为单位对基因组与转录组数据进行对应分析,将 DNA 层面的变异信息与 RNA 层面的表达信息结合考察。由于数据来自单一患者,分析结论应限定在该患者范围内。关于数据的具体下载方式、文件组织结构和分析流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为单一尤文肉瘤患者的样本数据,样本规模有限,不适合直接用于群体层面的比较或泛化结论。数据仅覆盖基因组与转录组序列层面,源站未提供临床随访、治疗响应等其他类型信息。关于数据质量评估、测序深度、覆盖度及质控指标,源站未提供。

【引用与许可】

该数据产生于 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究,来源于 omicsdi.org。关于具体的引用格式、数据许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001002552

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

来自一名尤文肉瘤患者的基因组和转录组序列数据,作为BC癌症机构个性化肿瘤基因组学(POG)研究的一部分生成。

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